237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4395 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  98.02 
 
 		 504 aa  974    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  91.65 
 
 		 504 aa  914    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  91.6 
 
 		 504 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  92.05 
 
 		 504 aa  918    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  67.07 
 
 		 497 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  66.34 
 
 		 504 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  66.34 
 
 		 504 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  98.02 
 
 		 504 aa  971    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  97.22 
 
 		 504 aa  964    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.93 
 
 		 505 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  66.07 
 
 		 504 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  65.59 
 
 		 500 aa  671    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  987    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  66.34 
 
 		 504 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  89.94 
 
 		 505 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  66.34 
 
 		 504 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  72.42 
 
 		 506 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  66.07 
 
 		 505 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  89.52 
 
 		 505 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  83.1 
 
 		 506 aa  822    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.75 
 
 		 500 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  60.4 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  50.98 
 
 		 508 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  56.96 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.92 
 
 		 503 aa  504  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  55.53 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  52.92 
 
 		 503 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  50.2 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  50.89 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  52.92 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  49.3 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.42 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  43.82 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.82 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  43.82 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  43.82 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  44.22 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  44.58 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  43.82 
 
 		 506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.96 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  43.4 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  45.18 
 
 		 508 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.82 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  45.58 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.18 
 
 		 519 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  42.83 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  44.44 
 
 		 515 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.03 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.45 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  43.35 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.38 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  43.51 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  43.82 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  41.97 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.69 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  42.83 
 
 		 500 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.58 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  41.77 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  41.24 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  41.04 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  44.47 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  41.8 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  43.42 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  44.16 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.8 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  42.09 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  42.95 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.6 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  43.54 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  44.96 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  43.82 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.8 
 
 		 536 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  41.12 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.23 
 
 		 507 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  41.47 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  41.93 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  42.54 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.19 
 
 		 500 aa  360  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  43.01 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.24 
 
 		 504 aa  359  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  41.95 
 
 		 500 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  40.49 
 
 		 502 aa  359  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  41.94 
 
 		 502 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3487  hypothetical protein  43.51 
 
 		 508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.812396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  42.15 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  41.02 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  43.97 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  42.04 
 
 		 510 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.36 
 
 		 509 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  42.25 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.15 
 
 		 505 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  42.26 
 
 		 504 aa  349  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  40.67 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  41.2 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.56 
 
 		 505 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  39.1 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.32 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  41.55 
 
 		 505 aa  346  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  42.07 
 
 		 500 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  40.94 
 
 		 512 aa  345  8e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>