237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3104 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1016    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  59.83 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.58 
 
 		 511 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  56.14 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  54.24 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  56.42 
 
 		 504 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  53 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  54.96 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  53.95 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  53.59 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  51.07 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  52.03 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.26 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  52.05 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  52.63 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  50.78 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.68 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  54.7 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  52.17 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  54.71 
 
 		 505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.37 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  54.51 
 
 		 505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.78 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  50.48 
 
 		 504 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  52.82 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  52.51 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  52.42 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  51.44 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.81 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  51.39 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  53.73 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.09 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  48.92 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  54.56 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  54.56 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  54.56 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.29 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  48.55 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  52.49 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.82 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.15 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  51.06 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  44.75 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.41 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.36 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  44.09 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.4 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.09 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.79 
 
 		 518 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  43.02 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.92 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  43.5 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  43.6 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  42.94 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.46 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  42.72 
 
 		 502 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.66 
 
 		 519 aa  360  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  43.93 
 
 		 500 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.47 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  40.87 
 
 		 505 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  39.41 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.27 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.12 
 
 		 536 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  40.19 
 
 		 504 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  40.95 
 
 		 505 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.42 
 
 		 500 aa  352  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  44.71 
 
 		 503 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.12 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.61 
 
 		 501 aa  349  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  38.72 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  41.13 
 
 		 502 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  41.44 
 
 		 503 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.53 
 
 		 536 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  41.52 
 
 		 508 aa  343  5.999999999999999e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  38.84 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.84 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.84 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.84 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.84 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.86 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  38.84 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  41.89 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  43.5 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  39.73 
 
 		 508 aa  340  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.68 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  39.58 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  42.47 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  40.35 
 
 		 508 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.82 
 
 		 503 aa  336  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  40.12 
 
 		 501 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.92 
 
 		 501 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.62 
 
 		 502 aa  335  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  39.67 
 
 		 503 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.23 
 
 		 501 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  38.94 
 
 		 509 aa  332  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  38.42 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.23 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  41.76 
 
 		 504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  41.41 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  42.17 
 
 		 500 aa  327  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>