237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003382 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  100 
 
 		 508 aa  995    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  88.56 
 
 		 509 aa  859    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  97.05 
 
 		 508 aa  948    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  69.51 
 
 		 506 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  69.51 
 
 		 506 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  69.51 
 
 		 506 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  69.11 
 
 		 506 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.51 
 
 		 506 aa  678    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  69.51 
 
 		 506 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  83.07 
 
 		 509 aa  838    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  86.81 
 
 		 508 aa  900    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3487  hypothetical protein  58.45 
 
 		 508 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.812396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3121  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.66 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0986619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2730  hypothetical protein  58.91 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.8 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.2 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  45.44 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  45.13 
 
 		 504 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.89 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  45.58 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  45.18 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  45.18 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  45.38 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.68 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.48 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  43.34 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.68 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.48 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  45.18 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.68 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  44.83 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  42.24 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  44.54 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.69 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  45.23 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  42.54 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  43.56 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  45.51 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.09 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  46.65 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.33 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  41.81 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  43.06 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.6 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  44.49 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  43.91 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.23 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.48 
 
 		 519 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  41.77 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  44.65 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  42.47 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  42.65 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  42.65 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  43.31 
 
 		 500 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.98 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.56 
 
 		 536 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  43.31 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.08 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  44.89 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  42.83 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.4 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  46.51 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  40.93 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  42.02 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.24 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  40.94 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.62 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.13 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  41.78 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  41.89 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  46.72 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  44.58 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  43.85 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  42.6 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  44.47 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.53 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  41.18 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  48.02 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  45.34 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  44 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  42.8 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.97 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  44.87 
 
 		 504 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.95 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.7 
 
 		 503 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.2 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  42.83 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  44 
 
 		 503 aa  359  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  42.28 
 
 		 500 aa  359  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  43.68 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  41.55 
 
 		 504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  42.8 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.49 
 
 		 500 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.49 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  42.94 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.83 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  43.49 
 
 		 500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  38.38 
 
 		 509 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  39.12 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  44.2 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>