239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0740 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  99 
 
 		 500 aa  981    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  91.4 
 
 		 500 aa  924    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  88 
 
 		 500 aa  875    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  86.8 
 
 		 500 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  88.4 
 
 		 500 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  75.15 
 
 		 503 aa  745    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  81 
 
 		 500 aa  839    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  66.2 
 
 		 505 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.2 
 
 		 501 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  75.3 
 
 		 504 aa  704    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  65.47 
 
 		 505 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  72.76 
 
 		 504 aa  715    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  77.14 
 
 		 504 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  75.75 
 
 		 503 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  80.2 
 
 		 500 aa  792    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  66.4 
 
 		 504 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  75.35 
 
 		 503 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.93 
 
 		 504 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  65.6 
 
 		 501 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  64.67 
 
 		 503 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  88.4 
 
 		 500 aa  875    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  87.6 
 
 		 500 aa  868    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  69.54 
 
 		 499 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.6 
 
 		 501 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 500 aa  991    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  76.94 
 
 		 503 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  65.05 
 
 		 502 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  62 
 
 		 500 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  65.6 
 
 		 502 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  76.34 
 
 		 503 aa  737    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  76.54 
 
 		 506 aa  740    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  75.55 
 
 		 503 aa  720    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  75.15 
 
 		 503 aa  747    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  75.94 
 
 		 503 aa  705    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  76.8 
 
 		 502 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.6 
 
 		 500 aa  648    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  63.05 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  66.47 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.05 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  62.4 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  68.26 
 
 		 500 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  63.45 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  62.45 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.65 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.65 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  58.18 
 
 		 505 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  55.35 
 
 		 506 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  55.93 
 
 		 507 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  52.73 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  52.42 
 
 		 496 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.1 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  49.4 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.9 
 
 		 519 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  49.16 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  50.51 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  50.32 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.06 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  48.4 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  47.68 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.79 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.21 
 
 		 531 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.69 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  47.06 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  47.15 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.44 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  48.31 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  47.36 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  44.78 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  47.46 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  47.46 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.95 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  45.58 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.63 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  48.41 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.63 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.63 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  46.76 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.63 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.43 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.8 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.78 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  47.16 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.48 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  42.23 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.43 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  43 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  43 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  43 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  47.01 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  43 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  43.2 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.15 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  45.55 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.95 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  42.03 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  46.61 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  49.79 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  42.8 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  46.48 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>