239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3964 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  84.8 
 
 		 500 aa  872    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  77.93 
 
 		 503 aa  729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  91.2 
 
 		 500 aa  899    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  96.6 
 
 		 500 aa  935    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  89.4 
 
 		 500 aa  859    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  66.33 
 
 		 505 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  87.6 
 
 		 500 aa  870    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.14 
 
 		 504 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  79.72 
 
 		 503 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  76.29 
 
 		 504 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.6 
 
 		 501 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  65.27 
 
 		 505 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  76.74 
 
 		 503 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  67.27 
 
 		 502 aa  634    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  77.93 
 
 		 504 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  87 
 
 		 500 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  65.14 
 
 		 504 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  71.94 
 
 		 499 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  70 
 
 		 500 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  66 
 
 		 501 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  64.67 
 
 		 503 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  77.34 
 
 		 506 aa  753    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  76.74 
 
 		 503 aa  757    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  92.8 
 
 		 500 aa  910    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  989    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  79.8 
 
 		 500 aa  783    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  63.86 
 
 		 501 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  63.51 
 
 		 502 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  74.35 
 
 		 504 aa  721    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66 
 
 		 501 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  81.2 
 
 		 500 aa  838    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  64.8 
 
 		 502 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.86 
 
 		 501 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  77.53 
 
 		 503 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  77.34 
 
 		 503 aa  730    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  76.94 
 
 		 503 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  78.13 
 
 		 503 aa  727    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  78.4 
 
 		 502 aa  746    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  61.85 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  60.4 
 
 		 500 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  67.2 
 
 		 500 aa  618  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  62.45 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.45 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  61.45 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.45 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  57.31 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.96 
 
 		 506 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  54.56 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  54.44 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  53.09 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.41 
 
 		 536 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  49.09 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  50.42 
 
 		 515 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  48.39 
 
 		 513 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.11 
 
 		 519 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  50.71 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.06 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  49.37 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.98 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  47.6 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  48.48 
 
 		 531 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.6 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  46.32 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  47.87 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  47.26 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.6 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  44.75 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  45.58 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.53 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  44.44 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.6 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.45 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  43.45 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  46.82 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  43.45 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  47.83 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  43.45 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.82 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  43.65 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.75 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  46.67 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.5 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  48.62 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  47.36 
 
 		 495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.66 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  46.2 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.08 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  48.88 
 
 		 502 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  40.04 
 
 		 504 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  45.97 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  40.04 
 
 		 504 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  47.22 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  45.22 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  46.61 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  47.39 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  47.13 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  40.04 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  47.13 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  40.04 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  39.84 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>