237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2146 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 517 aa  994    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  76.49 
 
 		 518 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.57 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.58 
 
 		 503 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  62.22 
 
 		 501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.23 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  52.58 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  56.78 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  52.83 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  49.21 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  52.87 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  49.61 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  51.61 
 
 		 489 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  51.26 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  51.39 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.14 
 
 		 511 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  51.87 
 
 		 495 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  48.06 
 
 		 509 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.78 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.78 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  53.16 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  49.9 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  50.19 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  51.58 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.81 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  51.77 
 
 		 505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  51.03 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  52.08 
 
 		 505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  51.56 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  49.9 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.21 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  48.31 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  48.21 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  48.43 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  50.94 
 
 		 497 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  51.24 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  50.72 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.06 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  50.49 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  54.11 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  54.11 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  54.11 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.76 
 
 		 538 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.71 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  47.37 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.71 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  41.78 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.19 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  39.33 
 
 		 500 aa  359  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  39.92 
 
 		 504 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  39.56 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  38.57 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  38.72 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  41.18 
 
 		 503 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  37.6 
 
 		 500 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.08 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.42 
 
 		 500 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  37.97 
 
 		 500 aa  347  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.21 
 
 		 500 aa  347  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  37.74 
 
 		 506 aa  346  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  40.8 
 
 		 505 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  39.21 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  40.42 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.18 
 
 		 503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  38.97 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  40.04 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  37.14 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  39.33 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.33 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  39.79 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.09 
 
 		 506 aa  336  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  37.92 
 
 		 504 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  38.45 
 
 		 506 aa  334  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  37.5 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  37.72 
 
 		 504 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.91 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  36.87 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  36.87 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  36.87 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  36.87 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.5 
 
 		 503 aa  333  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  36.87 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  37.33 
 
 		 504 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  37.52 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  39.17 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.69 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  36.67 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  36.67 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  36.67 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  38.97 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  37.97 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.67 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  40.35 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.97 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  38.86 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  36.65 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  38.01 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  38.63 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  39.58 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  37.23 
 
 		 504 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>