239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3457 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.6 
 
 
500 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  64.6 
 
 
500 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  65 
 
 
500 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  65 
 
 
500 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  66 
 
 
500 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  64.74 
 
 
505 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  64.02 
 
 
504 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  65.4 
 
 
500 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  66 
 
 
500 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  65.81 
 
 
503 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
501 aa  976    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  65.32 
 
 
502 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  91.4 
 
 
501 aa  863    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  98.4 
 
 
501 aa  962    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  88.62 
 
 
502 aa  825    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  83.6 
 
 
502 aa  831    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.95 
 
 
504 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.2 
 
 
500 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  64.2 
 
 
500 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  72.95 
 
 
499 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.21 
 
 
503 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  62.67 
 
 
505 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  64.81 
 
 
503 aa  631  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66 
 
 
506 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  66.4 
 
 
503 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  67 
 
 
503 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  63.78 
 
 
502 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64 
 
 
500 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  62.25 
 
 
501 aa  623  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.05 
 
 
501 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  65.2 
 
 
502 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  65.67 
 
 
504 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  62.67 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  63.69 
 
 
504 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.41 
 
 
503 aa  604  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66 
 
 
503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  65.41 
 
 
503 aa  601  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  64.94 
 
 
504 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.4 
 
 
500 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  58.2 
 
 
500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  62 
 
 
500 aa  571  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  61.04 
 
 
500 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  56.69 
 
 
505 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  54.56 
 
 
507 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.84 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  60.64 
 
 
500 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.64 
 
 
500 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.42 
 
 
519 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  49.69 
 
 
496 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  49.8 
 
 
505 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.9 
 
 
506 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  50.1 
 
 
512 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.16 
 
 
536 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.91 
 
 
536 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  49.69 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.26 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.75 
 
 
504 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.89 
 
 
519 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  49 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  49.9 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  46.46 
 
 
529 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  45.94 
 
 
531 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.43 
 
 
508 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.27 
 
 
503 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  49.39 
 
 
502 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.94 
 
 
502 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  45.34 
 
 
508 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  46.2 
 
 
499 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  47.9 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  44.53 
 
 
504 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.8 
 
 
500 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  45.97 
 
 
500 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  45.98 
 
 
499 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  44.14 
 
 
504 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  46.93 
 
 
505 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  45.98 
 
 
505 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  45.67 
 
 
504 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  44.38 
 
 
509 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.27 
 
 
504 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  43.11 
 
 
506 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  43.11 
 
 
506 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.44 
 
 
503 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  42.27 
 
 
504 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  42.27 
 
 
504 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  43.11 
 
 
506 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  42.8 
 
 
506 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  42.27 
 
 
504 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.11 
 
 
506 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  42.27 
 
 
504 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.41 
 
 
506 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  45.38 
 
 
501 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  45.6 
 
 
515 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.38 
 
 
509 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  47.15 
 
 
495 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  43.06 
 
 
505 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.45 
 
 
505 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.49 
 
 
504 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.85 
 
 
505 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.88 
 
 
500 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.65 
 
 
505 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>