238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2050 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  100 
 
 		 515 aa  1023    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.1 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.76 
 
 		 503 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  44.98 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  44.98 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  44.98 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  44.98 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  44.98 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  44.69 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  45.29 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.93 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  49.57 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  44.25 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.87 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  47.48 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  45.1 
 
 		 505 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.49 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  43.89 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.49 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.54 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.73 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  44.57 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  44.55 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.6 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  44.47 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  44.75 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  45.19 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  46.43 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  45.26 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  47.13 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  45.6 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  44.62 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  44.44 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  43.85 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  44.91 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.15 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.4 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  43.85 
 
 		 504 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  44.4 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.51 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  45.88 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  44.35 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.86 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  47.45 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  43.35 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  44.29 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  42.57 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  45.91 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.15 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.4 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  42.63 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  47.23 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  42.02 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  46.84 
 
 		 489 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  43.2 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.77 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.58 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.66 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  44.78 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  43.52 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.77 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  45.89 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.93 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  45.67 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  46.78 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.47 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  43.1 
 
 		 500 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  46.3 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  43.91 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  45.04 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.76 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  45.97 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  43.2 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.51 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  44.23 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  43.26 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  44.59 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  44.83 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  43.58 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  42.83 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  42.42 
 
 		 500 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  45.06 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  43.09 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  46.09 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  44.4 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.09 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  44.96 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  44.63 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  43.63 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.82 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.46 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  44.42 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  43.46 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  44.09 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  46.19 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.37 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  45.05 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  45.34 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.38 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>