237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3198 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  974    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  72.46 
 
 
508 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.12 
 
 
503 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.17 
 
 
536 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.01 
 
 
508 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.82 
 
 
497 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.04 
 
 
502 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.11 
 
 
519 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  45.17 
 
 
505 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.62 
 
 
503 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  45 
 
 
505 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.17 
 
 
536 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  43.17 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.13 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  44.56 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  47.4 
 
 
500 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  44.65 
 
 
500 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  45.01 
 
 
500 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  44.94 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.91 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  43.09 
 
 
500 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  43.26 
 
 
500 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.7 
 
 
500 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  45.51 
 
 
502 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.06 
 
 
506 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.29 
 
 
500 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  43.89 
 
 
504 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  45.06 
 
 
515 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  43.94 
 
 
504 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.22 
 
 
504 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  43.98 
 
 
500 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  42.83 
 
 
502 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  42.77 
 
 
508 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  42.41 
 
 
503 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  42.74 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  42.74 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  44.09 
 
 
496 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  42.28 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  40.52 
 
 
508 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  42.28 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  42.74 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  43.88 
 
 
506 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.01 
 
 
500 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.18 
 
 
505 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  43.17 
 
 
500 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  44.08 
 
 
504 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  43.84 
 
 
512 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  42.2 
 
 
506 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  41.67 
 
 
509 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  44.47 
 
 
499 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.21 
 
 
506 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  43.28 
 
 
501 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  41.95 
 
 
506 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  42.6 
 
 
506 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  42.6 
 
 
506 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  42.6 
 
 
506 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  40.76 
 
 
507 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  44.49 
 
 
504 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.6 
 
 
506 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.67 
 
 
509 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  43.97 
 
 
500 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  43.25 
 
 
505 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  43.19 
 
 
501 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  45.44 
 
 
512 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  43.75 
 
 
495 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.07 
 
 
501 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  43.54 
 
 
506 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  43.89 
 
 
499 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  42.07 
 
 
503 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  41.75 
 
 
504 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  41.23 
 
 
503 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  41.75 
 
 
504 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  42.57 
 
 
504 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  43.29 
 
 
495 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  44.56 
 
 
509 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  42.43 
 
 
510 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  41.04 
 
 
508 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.16 
 
 
509 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.88 
 
 
501 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  41.33 
 
 
508 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.73 
 
 
501 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.07 
 
 
503 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.07 
 
 
504 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  43.03 
 
 
495 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  42.6 
 
 
507 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  42.23 
 
 
510 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  47.46 
 
 
502 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  42.48 
 
 
499 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  40.83 
 
 
506 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  43.78 
 
 
505 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  41.27 
 
 
504 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  41.85 
 
 
504 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  41.32 
 
 
504 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  41.24 
 
 
504 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  41.36 
 
 
498 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  43.25 
 
 
504 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  43.57 
 
 
505 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  41.33 
 
 
502 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.26 
 
 
504 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>