237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1455 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  971    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  77.71 
 
 
501 aa  709    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  83.27 
 
 
508 aa  819    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  75.05 
 
 
506 aa  750    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  53.17 
 
 
504 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  58.56 
 
 
503 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  53.17 
 
 
504 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  53.4 
 
 
500 aa  528  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  53.17 
 
 
504 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  53.17 
 
 
504 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  53.17 
 
 
504 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  51.79 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  53.47 
 
 
506 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  51.81 
 
 
504 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  55.08 
 
 
505 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  51.59 
 
 
504 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  51.59 
 
 
504 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  50.89 
 
 
504 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  51.41 
 
 
504 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  51.21 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  50.82 
 
 
506 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  53.74 
 
 
498 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.3 
 
 
505 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.5 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.91 
 
 
503 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.53 
 
 
497 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  53.96 
 
 
495 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  52.94 
 
 
505 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  53.15 
 
 
505 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  52.72 
 
 
500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  50.2 
 
 
502 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.86 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.02 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.06 
 
 
503 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.91 
 
 
497 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.06 
 
 
519 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  40.16 
 
 
508 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  40.04 
 
 
500 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.32 
 
 
536 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  41.65 
 
 
506 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  41.39 
 
 
502 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  43.07 
 
 
503 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  43.63 
 
 
515 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  41.25 
 
 
509 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.23 
 
 
502 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  41.55 
 
 
508 aa  369  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  40.88 
 
 
500 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  41.94 
 
 
508 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  44.54 
 
 
504 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42 
 
 
504 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  42.21 
 
 
504 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  42.32 
 
 
504 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  41.09 
 
 
500 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.92 
 
 
536 aa  363  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  43.26 
 
 
503 aa  363  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.3 
 
 
504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.44 
 
 
500 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  43.55 
 
 
510 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  42.57 
 
 
509 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  43.97 
 
 
510 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.84 
 
 
500 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  43.94 
 
 
499 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  43.43 
 
 
505 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  39.41 
 
 
509 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.04 
 
 
506 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  39.09 
 
 
506 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  39.04 
 
 
506 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  39.04 
 
 
506 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  39.04 
 
 
506 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  41.88 
 
 
508 aa  360  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  42.12 
 
 
500 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  42.52 
 
 
502 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  40.44 
 
 
500 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  44.49 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  42.44 
 
 
505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  42.03 
 
 
499 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  38.89 
 
 
506 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  41.08 
 
 
499 aa  356  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  43 
 
 
505 aa  356  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.54 
 
 
503 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  41.34 
 
 
505 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  40.24 
 
 
500 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  41.79 
 
 
504 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.41 
 
 
509 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  40.26 
 
 
503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  43.37 
 
 
505 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  41.96 
 
 
505 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  40.17 
 
 
500 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  41.83 
 
 
499 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  43.84 
 
 
495 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  39.87 
 
 
500 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  41.11 
 
 
503 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  40.96 
 
 
509 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  41.1 
 
 
501 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.04 
 
 
509 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  40.9 
 
 
504 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.9 
 
 
501 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  38.96 
 
 
515 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  38 
 
 
509 aa  346  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  38.69 
 
 
512 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>