238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3315 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  81.39 
 
 		 505 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  82.57 
 
 		 505 aa  788    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  79.41 
 
 		 505 aa  736    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  78.99 
 
 		 514 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  80.59 
 
 		 505 aa  774    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  70.3 
 
 		 499 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  79.21 
 
 		 505 aa  737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  964    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  76.83 
 
 		 489 aa  715    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  80.99 
 
 		 505 aa  773    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  71.49 
 
 		 499 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  81.78 
 
 		 505 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  65.47 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  71.58 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  62.73 
 
 		 500 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  64.72 
 
 		 504 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  66.74 
 
 		 499 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  62.8 
 
 		 512 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  59.68 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  59.59 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  58.07 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  60.16 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  59.15 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  60.8 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.47 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.87 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  58.23 
 
 		 501 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  59.8 
 
 		 513 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.52 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  57.72 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  59.16 
 
 		 507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.76 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  62.3 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.6 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  60.85 
 
 		 497 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  56.34 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.13 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  61.47 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  61.47 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.08 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  61.47 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.4 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  52.82 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.36 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.21 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  48.48 
 
 		 501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  47.78 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.33 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  46.82 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  46.38 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.96 
 
 		 500 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  45.55 
 
 		 500 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.77 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  45.67 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  47.16 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.67 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  45.66 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  46.09 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.27 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  46.28 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  45.14 
 
 		 505 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  45.2 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  47.15 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  46.25 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  45.4 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  44.69 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.62 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.72 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.2 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  43.76 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  45.1 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  46.15 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  46.56 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  46.82 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.3 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  45.6 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  43.65 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.19 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.06 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  43.65 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  43.65 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  43.65 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  45.22 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.06 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.85 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  44.19 
 
 		 507 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.95 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  47.78 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.49 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.66 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  46.09 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  42.86 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  44.29 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.27 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.35 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  42.94 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  44.81 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  44.06 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  46.07 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>