237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2984 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  65.15 
 
 
504 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  64.66 
 
 
504 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  64.66 
 
 
504 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  82.22 
 
 
497 aa  789    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  65.79 
 
 
504 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  65.35 
 
 
504 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  88.47 
 
 
505 aa  852    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  99.8 
 
 
504 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  66.34 
 
 
504 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  69.3 
 
 
505 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  69.38 
 
 
506 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  100 
 
 
504 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  68.46 
 
 
500 aa  702    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  68.67 
 
 
498 aa  688    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  65.02 
 
 
506 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.11 
 
 
500 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  100 
 
 
504 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  84.2 
 
 
505 aa  837    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  99.6 
 
 
504 aa  992    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  69.3 
 
 
505 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  65.35 
 
 
504 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  99.8 
 
 
504 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  55.96 
 
 
495 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  52.63 
 
 
508 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  57.46 
 
 
500 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  53.17 
 
 
504 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.7 
 
 
503 aa  499  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  49.9 
 
 
506 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  51.2 
 
 
503 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  52.53 
 
 
501 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  51.31 
 
 
502 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.6 
 
 
508 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.25 
 
 
506 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  42.45 
 
 
508 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  43.17 
 
 
500 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  41.04 
 
 
500 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  44.98 
 
 
515 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  42.86 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  42.86 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.86 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.86 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  42.86 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  41.48 
 
 
508 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.23 
 
 
503 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  42.66 
 
 
506 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.63 
 
 
500 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  41.63 
 
 
500 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.43 
 
 
504 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  41.48 
 
 
508 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.88 
 
 
536 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  40.85 
 
 
509 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.99 
 
 
500 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  42.63 
 
 
502 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  41.04 
 
 
500 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.73 
 
 
519 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.4 
 
 
500 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  41.63 
 
 
500 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  41.08 
 
 
503 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.13 
 
 
501 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  41.13 
 
 
501 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  42.66 
 
 
502 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.39 
 
 
499 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  42.77 
 
 
505 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.24 
 
 
536 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  42.66 
 
 
509 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  41.47 
 
 
500 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.25 
 
 
502 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.15 
 
 
497 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  42.48 
 
 
504 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.19 
 
 
507 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.41 
 
 
505 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  42.06 
 
 
505 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.83 
 
 
504 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.58 
 
 
503 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  43.29 
 
 
502 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  41.11 
 
 
500 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  43.07 
 
 
503 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  41.58 
 
 
503 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  42.95 
 
 
503 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  42.83 
 
 
505 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  43.65 
 
 
505 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  41.19 
 
 
503 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.01 
 
 
505 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  41.85 
 
 
500 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.27 
 
 
501 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  42.36 
 
 
505 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  42.36 
 
 
505 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  41.09 
 
 
506 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  40.99 
 
 
502 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.71 
 
 
506 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  43.34 
 
 
500 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  43.14 
 
 
505 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  40.48 
 
 
499 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  41.77 
 
 
500 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  43.53 
 
 
504 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  43.07 
 
 
504 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  41.47 
 
 
505 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  43.14 
 
 
505 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  40.47 
 
 
509 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.06 
 
 
501 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>