237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2790 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
508 aa  988    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  55.04 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.29 
 
 
504 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  51.39 
 
 
504 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  48.41 
 
 
500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  51.58 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  49.39 
 
 
505 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  50.52 
 
 
500 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  50.96 
 
 
503 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.38 
 
 
500 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  45.6 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  45.6 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  45.6 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  50.11 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  45.6 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  50.2 
 
 
500 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  49.9 
 
 
500 aa  458  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.02 
 
 
502 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  50.1 
 
 
500 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  45.6 
 
 
504 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  46.93 
 
 
504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  48.5 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  47.42 
 
 
504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  46.46 
 
 
508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  47.33 
 
 
504 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  47.02 
 
 
504 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  48.8 
 
 
508 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  51.67 
 
 
500 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  47.21 
 
 
508 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  46.93 
 
 
504 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.19 
 
 
500 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.69 
 
 
500 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  46.63 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  46.83 
 
 
504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  48.8 
 
 
508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  46.65 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  49.02 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  45.73 
 
 
500 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.71 
 
 
536 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.52 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.22 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  46.22 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  45.31 
 
 
506 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  46.26 
 
 
506 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.75 
 
 
497 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  48.61 
 
 
502 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  46.56 
 
 
506 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  46.88 
 
 
509 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.19 
 
 
505 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.95 
 
 
503 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  48.76 
 
 
503 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  47.27 
 
 
503 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  48.09 
 
 
499 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  48.76 
 
 
503 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  46.17 
 
 
506 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  49.58 
 
 
499 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  48.29 
 
 
499 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.17 
 
 
506 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.21 
 
 
504 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  46.17 
 
 
506 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.43 
 
 
501 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.49 
 
 
497 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.15 
 
 
500 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.76 
 
 
503 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.03 
 
 
519 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  46.17 
 
 
506 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  46.09 
 
 
506 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.82 
 
 
501 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  46.17 
 
 
506 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  49.48 
 
 
505 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  47.14 
 
 
505 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  52.35 
 
 
502 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  48.82 
 
 
509 aa  422  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  47.94 
 
 
501 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  49.07 
 
 
505 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  44.14 
 
 
498 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.86 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  45.86 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  46.35 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  45.3 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  49.68 
 
 
502 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  45.42 
 
 
505 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  45.77 
 
 
495 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  48.13 
 
 
503 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  46.77 
 
 
502 aa  415  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.42 
 
 
505 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  47.93 
 
 
515 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.61 
 
 
505 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  44.75 
 
 
500 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  46.17 
 
 
489 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  48.85 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  48.34 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  46 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  44.69 
 
 
509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.37 
 
 
500 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  44.47 
 
 
495 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.93 
 
 
506 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.34 
 
 
500 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  48.41 
 
 
500 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  47.52 
 
 
503 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>