239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6378 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  84.29 
 
 		 503 aa  848    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  85.29 
 
 		 503 aa  839    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  73.56 
 
 		 500 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  86.08 
 
 		 503 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  76.74 
 
 		 500 aa  767    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  77.14 
 
 		 500 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  76.94 
 
 		 500 aa  745    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  83.9 
 
 		 503 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  63.96 
 
 		 505 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  73.16 
 
 		 500 aa  717    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  82.5 
 
 		 504 aa  777    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  64.95 
 
 		 505 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  76.54 
 
 		 500 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  78.73 
 
 		 504 aa  767    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  85.09 
 
 		 504 aa  798    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  65.15 
 
 		 504 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66 
 
 		 501 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  76.54 
 
 		 500 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  77.53 
 
 		 500 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  77.34 
 
 		 500 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 506 aa  993    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66 
 
 		 501 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  68.73 
 
 		 499 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.44 
 
 		 504 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  85.49 
 
 		 503 aa  826    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  83.9 
 
 		 503 aa  805    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  85.09 
 
 		 503 aa  835    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  86.68 
 
 		 503 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  72.37 
 
 		 500 aa  751    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  78.09 
 
 		 502 aa  745    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  63.42 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  66.2 
 
 		 501 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  67.46 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  63.69 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  62.28 
 
 		 502 aa  621  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.03 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  62.03 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.2 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  58.85 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  62.2 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  63.02 
 
 		 500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  60.04 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  60.04 
 
 		 500 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.64 
 
 		 500 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.44 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  56.02 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  54.22 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.88 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  51 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.76 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  49.6 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  49.19 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  48.88 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  48.27 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  48.8 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.29 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.7 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  46.5 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.84 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.32 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  45.92 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  46.96 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.92 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  45.65 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.73 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  45.4 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  46.72 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  46.4 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  46.01 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.09 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  42.09 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  42.09 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.09 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.79 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  42.09 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  42.49 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.48 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.68 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  45.69 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  42.8 
 
 		 508 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.71 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  45.4 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  42.94 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  46.2 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  47.47 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  42.94 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  42.94 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  42.94 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  41.78 
 
 		 509 aa  392  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  42.94 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  46.61 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.77 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  46.39 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  45.99 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.78 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  46.26 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  42.63 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  43.09 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.62 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  45.34 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>