240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3272 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1004    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  86.11 
 
 		 506 aa  856    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  53.54 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  55.53 
 
 		 500 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  53.63 
 
 		 500 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  55.24 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  54.84 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  54.26 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  56.38 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.73 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.94 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.68 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  53.07 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  51.92 
 
 		 500 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  52.01 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.8 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  53.28 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  52.02 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  54.33 
 
 		 504 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  52.34 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  51.7 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.99 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  50.42 
 
 		 501 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  50.6 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  47.89 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.64 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.8 
 
 		 501 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  47.28 
 
 		 505 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.21 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.07 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  48.58 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  53.5 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  47.78 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.28 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  51.99 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  52.65 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  51.38 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  50.21 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  48.93 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.49 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  45.67 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  50.7 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  47.55 
 
 		 503 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  45.74 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.89 
 
 		 500 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  45.07 
 
 		 519 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.68 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  49.68 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  44.95 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  48.61 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  44.44 
 
 		 529 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  45.86 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  44.44 
 
 		 531 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.16 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.92 
 
 		 536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  42.89 
 
 		 496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  42.94 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.78 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.22 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  42.51 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  43.52 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  41.15 
 
 		 500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  41.91 
 
 		 512 aa  356  6.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.88 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.39 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  39.39 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  39.39 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  39.39 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  39.19 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  39.31 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  39.29 
 
 		 504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  38.6 
 
 		 504 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  42.92 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.59 
 
 		 502 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  40.44 
 
 		 499 aa  342  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  38.24 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.55 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  38.12 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.31 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.04 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  37.8 
 
 		 504 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  40.51 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.2 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.54 
 
 		 508 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  40 
 
 		 505 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.27 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  38.12 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  39.66 
 
 		 504 aa  328  9e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.29 
 
 		 504 aa  329  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1976  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.16 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  40.5 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  39.24 
 
 		 499 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  38.09 
 
 		 504 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  38.27 
 
 		 505 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  36.33 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  36.33 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.33 
 
 		 504 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  36.33 
 
 		 504 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  36.33 
 
 		 504 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>