237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1698 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  69.32 
 
 
503 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
500 aa  962    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  98.4 
 
 
500 aa  950    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  70.12 
 
 
505 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.2 
 
 
504 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  70.12 
 
 
505 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  99.8 
 
 
500 aa  959    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  70.32 
 
 
504 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  71.8 
 
 
501 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  82.4 
 
 
500 aa  754    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  71.6 
 
 
501 aa  715    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  61.45 
 
 
500 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  61.65 
 
 
500 aa  627  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  62.45 
 
 
500 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  60.84 
 
 
500 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.85 
 
 
500 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.65 
 
 
500 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  60.64 
 
 
500 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  60.84 
 
 
500 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  61.24 
 
 
500 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.64 
 
 
500 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  60.48 
 
 
503 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  60.16 
 
 
502 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  60.52 
 
 
502 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.48 
 
 
503 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  60.64 
 
 
502 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  62.45 
 
 
499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  60.08 
 
 
503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.04 
 
 
501 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.64 
 
 
501 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.44 
 
 
506 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.25 
 
 
500 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  58.68 
 
 
504 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  60.08 
 
 
503 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  59.88 
 
 
503 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  60.48 
 
 
504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  60.44 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  60.28 
 
 
503 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  60.72 
 
 
502 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  60.64 
 
 
504 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.88 
 
 
503 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.08 
 
 
503 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  63.65 
 
 
500 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  56.97 
 
 
502 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  55.42 
 
 
500 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  55.11 
 
 
505 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  50.91 
 
 
507 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  48.38 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.29 
 
 
506 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.59 
 
 
536 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.02 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  50.41 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.2 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  47.98 
 
 
512 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  48.01 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  46.43 
 
 
515 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.76 
 
 
504 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.11 
 
 
536 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  44.31 
 
 
513 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  45.09 
 
 
529 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.81 
 
 
508 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  51.12 
 
 
502 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  43.43 
 
 
531 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  45.73 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.02 
 
 
502 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.48 
 
 
503 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  42.4 
 
 
506 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.4 
 
 
506 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  42.4 
 
 
506 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  42.6 
 
 
506 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.4 
 
 
506 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  42.4 
 
 
506 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  47.69 
 
 
504 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.13 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.13 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.13 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.13 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  40.91 
 
 
508 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.13 
 
 
504 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.6 
 
 
500 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  44.91 
 
 
504 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  46.28 
 
 
509 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  44.51 
 
 
504 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  46.22 
 
 
499 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.48 
 
 
509 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  43.53 
 
 
508 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  45.28 
 
 
495 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  46.41 
 
 
499 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  43.74 
 
 
508 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.4 
 
 
504 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  42 
 
 
504 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1976  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.97 
 
 
488 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.37 
 
 
500 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  44.44 
 
 
500 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.01 
 
 
505 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.98 
 
 
503 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  46.12 
 
 
489 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  41.6 
 
 
504 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  43.58 
 
 
506 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  43.11 
 
 
505 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>