237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4018 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  72.17 
 
 
500 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  76.74 
 
 
500 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  77.53 
 
 
500 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  76.34 
 
 
500 aa  731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  63.89 
 
 
505 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  73.96 
 
 
500 aa  759    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  84.46 
 
 
504 aa  788    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  66 
 
 
505 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  87.87 
 
 
504 aa  813    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  64.88 
 
 
504 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  86.68 
 
 
506 aa  836    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  88.27 
 
 
503 aa  878    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  77.34 
 
 
500 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  78.13 
 
 
500 aa  770    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  75.94 
 
 
500 aa  745    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  80.12 
 
 
504 aa  776    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  89.26 
 
 
503 aa  822    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  88.47 
 
 
503 aa  865    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  86.68 
 
 
503 aa  800    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  74.55 
 
 
500 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  90.46 
 
 
503 aa  861    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  86.48 
 
 
503 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  88.87 
 
 
503 aa  867    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  986    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.67 
 
 
504 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  77.49 
 
 
502 aa  732    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  75.75 
 
 
500 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  65.61 
 
 
503 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  67.33 
 
 
499 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.61 
 
 
501 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.41 
 
 
501 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  64.41 
 
 
502 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  63.47 
 
 
502 aa  621  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.67 
 
 
501 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  62.67 
 
 
501 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  65.41 
 
 
501 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  67.99 
 
 
500 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  65.87 
 
 
502 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  59.84 
 
 
500 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  61.4 
 
 
502 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  65.21 
 
 
500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  60.88 
 
 
500 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.28 
 
 
500 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.48 
 
 
500 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  56.54 
 
 
507 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  58.68 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  55.69 
 
 
505 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.7 
 
 
506 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  51.89 
 
 
505 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.09 
 
 
536 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  51.21 
 
 
496 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  48.68 
 
 
519 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  49.69 
 
 
515 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  48.79 
 
 
513 aa  465  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.4 
 
 
519 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  48.47 
 
 
529 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  47.41 
 
 
512 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.63 
 
 
536 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.05 
 
 
504 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  46.59 
 
 
503 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.13 
 
 
531 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  48.89 
 
 
504 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.21 
 
 
503 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  46.86 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  44.6 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  44 
 
 
506 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  44 
 
 
506 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  44 
 
 
506 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44 
 
 
506 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  44 
 
 
506 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.33 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.88 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  42.29 
 
 
508 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.69 
 
 
500 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.95 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.33 
 
 
505 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  44.58 
 
 
500 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.95 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.53 
 
 
505 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  46 
 
 
505 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.95 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.95 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  45.47 
 
 
504 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.95 
 
 
504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  45.45 
 
 
505 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  42.89 
 
 
509 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.05 
 
 
502 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  46.37 
 
 
502 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  45.66 
 
 
499 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  43.63 
 
 
509 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  42.4 
 
 
504 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  43.03 
 
 
508 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.47 
 
 
505 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.97 
 
 
500 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.89 
 
 
511 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.8 
 
 
505 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  43.95 
 
 
501 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.28 
 
 
504 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  41.6 
 
 
504 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  46.43 
 
 
504 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>