237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2387 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  966    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  58.6 
 
 
507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  56.1 
 
 
512 aa  558  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  58.25 
 
 
504 aa  535  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  52.46 
 
 
500 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  53.83 
 
 
500 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  51.01 
 
 
500 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  51.94 
 
 
515 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  53.62 
 
 
500 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.18 
 
 
500 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.01 
 
 
500 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  51.62 
 
 
502 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.42 
 
 
500 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  54.68 
 
 
499 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  50.52 
 
 
519 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  51.98 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  53.19 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  50.96 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  49.38 
 
 
513 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.71 
 
 
504 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  52.98 
 
 
500 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  51.05 
 
 
505 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.32 
 
 
503 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  49.69 
 
 
502 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  49.79 
 
 
503 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  50.53 
 
 
503 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  50.1 
 
 
501 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  50.32 
 
 
500 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.31 
 
 
501 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  49.8 
 
 
505 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.9 
 
 
501 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  51.91 
 
 
531 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  49.39 
 
 
504 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.69 
 
 
501 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  50.96 
 
 
502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  52.53 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  50.11 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  50.84 
 
 
503 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  50.31 
 
 
529 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.32 
 
 
506 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  50.64 
 
 
503 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  53.67 
 
 
500 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.78 
 
 
500 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  51.23 
 
 
503 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  51.16 
 
 
504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.44 
 
 
536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.53 
 
 
503 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  51.8 
 
 
503 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  48.39 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.26 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  49.47 
 
 
504 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  50.21 
 
 
500 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.85 
 
 
500 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.06 
 
 
500 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.84 
 
 
519 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  50.64 
 
 
500 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  47.17 
 
 
505 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.68 
 
 
536 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.47 
 
 
506 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  42.89 
 
 
505 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.91 
 
 
504 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  45.36 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  45.79 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.48 
 
 
503 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.75 
 
 
506 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  41.75 
 
 
506 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  41.75 
 
 
506 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  41.75 
 
 
506 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1976  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.06 
 
 
488 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  41.75 
 
 
506 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  43.49 
 
 
508 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  41.75 
 
 
506 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.94 
 
 
502 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  44.69 
 
 
505 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.85 
 
 
508 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  43.01 
 
 
505 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  40.53 
 
 
504 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  40.53 
 
 
504 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.94 
 
 
505 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  40.53 
 
 
504 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  42.83 
 
 
508 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  40.53 
 
 
504 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  40.53 
 
 
504 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  43.71 
 
 
508 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  45.03 
 
 
489 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.94 
 
 
505 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  45.92 
 
 
505 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  44.26 
 
 
505 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.91 
 
 
497 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  44.1 
 
 
499 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  43.31 
 
 
507 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  42.63 
 
 
509 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  42.36 
 
 
506 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  44.68 
 
 
504 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  47.33 
 
 
508 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  43.44 
 
 
495 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  42.62 
 
 
505 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  40.65 
 
 
509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  45.4 
 
 
505 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  42.17 
 
 
504 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>