237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1515 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  71.4 
 
 		 500 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  70.97 
 
 		 505 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  72.71 
 
 		 503 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  73.61 
 
 		 505 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  71.8 
 
 		 500 aa  657    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  70.78 
 
 		 504 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  72.51 
 
 		 504 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  71.6 
 
 		 500 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  72 
 
 		 500 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  99.8 
 
 		 501 aa  971    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 501 aa  975    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  63.86 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  64.46 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  63.86 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  63.86 
 
 		 500 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  64.26 
 
 		 500 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  61.85 
 
 		 500 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  62.65 
 
 		 500 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.05 
 
 		 500 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  63.13 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  64.26 
 
 		 499 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.05 
 
 		 500 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  62.28 
 
 		 503 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.25 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.28 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  61.88 
 
 		 503 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.05 
 
 		 501 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  63.8 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.84 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  61.85 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.86 
 
 		 500 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  64.09 
 
 		 504 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  59.56 
 
 		 502 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  60.76 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  61.52 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  61.28 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.03 
 
 		 506 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  62.28 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  61.88 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  62.67 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  62.08 
 
 		 503 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.27 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.88 
 
 		 503 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  56.02 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  62.05 
 
 		 500 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  56.18 
 
 		 505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  51.8 
 
 		 507 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  50.21 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  50.4 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.72 
 
 		 519 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.11 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  49.9 
 
 		 496 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.24 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.98 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.63 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.09 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  47.48 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.55 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  46.27 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  45.55 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.9 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  45.65 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.22 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0662  hypothetical protein  48.85 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  48.69 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.76 
 
 		 502 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  44.96 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.13 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.51 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.33 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.13 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.13 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.13 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.9 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  44.74 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  45.34 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.34 
 
 		 505 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  46.15 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  45.89 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  44.49 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  42.74 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  42.18 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  44.53 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  42 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  42.18 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.25 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  46.44 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  43.31 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  41.8 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.49 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.81 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  46.35 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  44.42 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.2 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  44.15 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  42.6 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.65 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  40.08 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.68 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  40.68 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>