237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2745 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  71.37 
 
 		 500 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  75.75 
 
 		 500 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  76.74 
 
 		 500 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  75.94 
 
 		 500 aa  727    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  74.35 
 
 		 500 aa  764    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  64.48 
 
 		 505 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  90.26 
 
 		 503 aa  837    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  85.06 
 
 		 504 aa  792    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  74.95 
 
 		 500 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  66.4 
 
 		 505 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  86.88 
 
 		 504 aa  807    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  64.88 
 
 		 504 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  65.81 
 
 		 503 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  90.85 
 
 		 503 aa  904    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  75.15 
 
 		 500 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  85.29 
 
 		 506 aa  824    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.67 
 
 		 504 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  76.34 
 
 		 500 aa  750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  76.74 
 
 		 500 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  86.68 
 
 		 503 aa  803    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 503 aa  988    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  77.53 
 
 		 504 aa  757    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  74.55 
 
 		 500 aa  727    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  93.24 
 
 		 503 aa  886    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  87.08 
 
 		 503 aa  825    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  98.81 
 
 		 503 aa  979    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  88.47 
 
 		 503 aa  827    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  77.09 
 
 		 502 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  67.33 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.01 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.21 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  63.02 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  62.28 
 
 		 501 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  64 
 
 		 502 aa  618  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.28 
 
 		 501 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  68.99 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  64.81 
 
 		 501 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  66.47 
 
 		 502 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  58.65 
 
 		 500 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  65.41 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  60 
 
 		 502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  59.48 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  61.08 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.68 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  55.91 
 
 		 507 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.48 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  55.29 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.41 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  50.5 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  48.68 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  51.25 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  50 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  50.1 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.18 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  48.79 
 
 		 529 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  48.61 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.6 
 
 		 519 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  47.86 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.4 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  47 
 
 		 503 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  47.78 
 
 		 504 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.53 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  45.92 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.92 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.86 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  46.8 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  42.86 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.53 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.33 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  42.86 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  45.67 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  42.86 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  43.25 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  45.26 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.86 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.86 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  44.4 
 
 		 508 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  44.6 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.27 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  44.71 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  42.51 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.62 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  44.8 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  45.88 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.54 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  46.01 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  45.4 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  42.4 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  44.4 
 
 		 489 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  40.95 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  40.95 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  42.4 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.48 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  43.18 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.37 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  40.95 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  40.95 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  45.06 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  44.92 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>