237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2583 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  66.46 
 
 
504 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  66.46 
 
 
504 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  66.46 
 
 
504 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  66.4 
 
 
504 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  66.67 
 
 
504 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  82.22 
 
 
504 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  82.22 
 
 
504 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  70.36 
 
 
506 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  66.87 
 
 
504 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  66.87 
 
 
500 aa  691    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  89.72 
 
 
505 aa  864    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
497 aa  976    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  82.02 
 
 
504 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.19 
 
 
500 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  67.07 
 
 
504 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  82.86 
 
 
505 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  65.04 
 
 
506 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  82.22 
 
 
504 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  82.22 
 
 
504 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  65.79 
 
 
498 aa  651    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  68.64 
 
 
505 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  68.43 
 
 
505 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  55.96 
 
 
495 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  58.55 
 
 
500 aa  508  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  50.4 
 
 
508 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.52 
 
 
503 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  50 
 
 
506 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  51.61 
 
 
504 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  52.12 
 
 
503 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  51.71 
 
 
501 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  51.11 
 
 
502 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.77 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  43.37 
 
 
508 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  44.29 
 
 
508 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  44.09 
 
 
508 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.85 
 
 
506 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  44.85 
 
 
506 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  44.85 
 
 
506 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  44.85 
 
 
506 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.98 
 
 
506 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  44.65 
 
 
506 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  44.38 
 
 
506 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  44.35 
 
 
500 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  42.66 
 
 
509 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  44.47 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.75 
 
 
519 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  44.21 
 
 
500 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  42.45 
 
 
503 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  43.56 
 
 
500 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.38 
 
 
536 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  43.78 
 
 
509 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  42.98 
 
 
500 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.4 
 
 
504 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.29 
 
 
497 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.29 
 
 
500 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.05 
 
 
503 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.57 
 
 
500 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.61 
 
 
503 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  43.99 
 
 
502 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  43.57 
 
 
504 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.18 
 
 
501 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  43.43 
 
 
502 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  45.05 
 
 
503 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  42.18 
 
 
501 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.89 
 
 
499 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  42.6 
 
 
500 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.91 
 
 
500 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44 
 
 
536 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  43.9 
 
 
503 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  43.61 
 
 
505 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  42.77 
 
 
500 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  43.98 
 
 
502 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  44.21 
 
 
500 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  45.26 
 
 
503 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  43.49 
 
 
503 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  43.78 
 
 
500 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.92 
 
 
504 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.23 
 
 
507 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  43.34 
 
 
504 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  42.45 
 
 
505 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.34 
 
 
501 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  42.25 
 
 
500 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  46.6 
 
 
504 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  42.28 
 
 
510 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  43.27 
 
 
505 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.93 
 
 
502 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.34 
 
 
501 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  42.6 
 
 
510 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  43.66 
 
 
502 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  41.01 
 
 
505 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  42.58 
 
 
501 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  42.8 
 
 
502 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  41.28 
 
 
504 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.42 
 
 
506 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  44.78 
 
 
504 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.21 
 
 
505 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  40.56 
 
 
509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  41.35 
 
 
499 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.96 
 
 
505 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  43.8 
 
 
503 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>