238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3006 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  998    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  75.71 
 
 		 512 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  90.31 
 
 		 516 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  75.3 
 
 		 539 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  90.31 
 
 		 516 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  93.95 
 
 		 513 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  90.5 
 
 		 516 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  64.01 
 
 		 504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  70.69 
 
 		 538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  62.42 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  60.28 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  65.82 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  59.01 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  58.61 
 
 		 505 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  58.61 
 
 		 505 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  58.35 
 
 		 495 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  59.6 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.61 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  58.35 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.42 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  62.65 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  58.95 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  60.21 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  56.82 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.62 
 
 		 507 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  54.62 
 
 		 509 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  55.73 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  54.77 
 
 		 495 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.81 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  54.76 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  54.45 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  54.56 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  57.91 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  56.59 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  52.42 
 
 		 520 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  56.47 
 
 		 507 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.76 
 
 		 513 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  54.47 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  57.14 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.22 
 
 		 504 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.95 
 
 		 511 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.8 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.13 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.75 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  47.61 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.08 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  45.45 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.23 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  44.16 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  44.8 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  44.37 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.4 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.33 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.29 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  44.29 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  43.5 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.59 
 
 		 500 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  42.47 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  44.49 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  42.69 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  44.68 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  42.06 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  43.82 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  42.45 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  46.07 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  42.86 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  45.59 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.37 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  43.62 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.03 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.6 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  41.62 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.76 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  40 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  41.15 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  42.77 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.23 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.5 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.9 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.05 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.95 
 
 		 501 aa  369  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.31 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  41.58 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.96 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.89 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  42.24 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  43.7 
 
 		 500 aa  365  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  42.47 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.8 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  42.29 
 
 		 515 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.8 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.8 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.7 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.8 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  39.12 
 
 		 506 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  38.92 
 
 		 506 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.66 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.09 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.29 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>