237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3162 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  963    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.68 
 
 
493 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  45.3 
 
 
500 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  41.63 
 
 
494 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  47.44 
 
 
498 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  41.88 
 
 
506 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  47.44 
 
 
498 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  41.72 
 
 
498 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  40.57 
 
 
494 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.26 
 
 
503 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  41.27 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  45.86 
 
 
496 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  45.86 
 
 
496 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  45.86 
 
 
496 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.51 
 
 
491 aa  345  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.8 
 
 
503 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.72 
 
 
503 aa  339  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.68 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  40.09 
 
 
503 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  39.66 
 
 
500 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  37.33 
 
 
506 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  38.79 
 
 
507 aa  333  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  38.76 
 
 
506 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  39.37 
 
 
502 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  39.06 
 
 
500 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.29 
 
 
502 aa  329  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  38.81 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  39.25 
 
 
506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  38.58 
 
 
504 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  38.58 
 
 
504 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  36.53 
 
 
500 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  38.58 
 
 
504 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  37.58 
 
 
504 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  38.46 
 
 
497 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  37.58 
 
 
504 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.85 
 
 
514 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.54 
 
 
509 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  37.94 
 
 
500 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  37.13 
 
 
508 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  40.51 
 
 
503 aa  323  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  36.8 
 
 
502 aa  322  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  37.93 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  38.96 
 
 
506 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.74 
 
 
501 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.56 
 
 
500 aa  319  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  36.61 
 
 
504 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  39.22 
 
 
503 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  38.01 
 
 
519 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  37.34 
 
 
505 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.71 
 
 
504 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  35.97 
 
 
504 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  37.55 
 
 
505 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  36.61 
 
 
504 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  37.68 
 
 
506 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  37.21 
 
 
506 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.44 
 
 
500 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.68 
 
 
506 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  37.68 
 
 
506 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  39.21 
 
 
498 aa  317  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  37.68 
 
 
506 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  37.68 
 
 
506 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.61 
 
 
504 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.07 
 
 
501 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.97 
 
 
519 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.14 
 
 
508 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  40.17 
 
 
499 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  36.75 
 
 
508 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.3 
 
 
536 aa  316  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.39 
 
 
536 aa  316  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  37 
 
 
504 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  37.87 
 
 
504 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  36.38 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  40.28 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  36.59 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.95 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.22 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  39.82 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  40.72 
 
 
504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  39.05 
 
 
503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  39.33 
 
 
499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.83 
 
 
516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.66 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  37.26 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  37.53 
 
 
658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  35.68 
 
 
502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.6 
 
 
500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  37.31 
 
 
505 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  36.88 
 
 
504 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  36.78 
 
 
504 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.59 
 
 
520 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  38.58 
 
 
500 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  37.95 
 
 
500 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  38.43 
 
 
658 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  39.79 
 
 
499 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  38.57 
 
 
500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  37.93 
 
 
506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  37.09 
 
 
509 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  35.76 
 
 
529 aa  309  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  38.43 
 
 
504 aa  309  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  37.26 
 
 
508 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>