239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0071 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  993    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  53 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  51.49 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.52 
 
 		 502 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  51.05 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  50.63 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  47.38 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  52.66 
 
 		 494 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0608  hypothetical protein  43.99 
 
 		 487 aa  327  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00222662  normal  0.0295774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  36.59 
 
 		 490 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  38.14 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.37 
 
 		 514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.86 
 
 		 516 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.99 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.34 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.31 
 
 		 503 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  36.79 
 
 		 498 aa  297  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  37.05 
 
 		 507 aa  296  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  35.92 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  38.51 
 
 		 498 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  37.33 
 
 		 498 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  39.29 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  39.29 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.18 
 
 		 520 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.34 
 
 		 491 aa  289  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.02 
 
 		 503 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  34.43 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  35.42 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.88 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  36.3 
 
 		 500 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  33.74 
 
 		 499 aa  273  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  34.09 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.29 
 
 		 504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.88 
 
 		 536 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32 
 
 		 519 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  33.19 
 
 		 508 aa  266  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  33.46 
 
 		 509 aa  266  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  34.05 
 
 		 496 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  34.59 
 
 		 504 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  32.49 
 
 		 505 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  32.42 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3183  hypothetical protein  32.36 
 
 		 494 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.44 
 
 		 515 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  32.85 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  33.69 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  30.6 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  33.83 
 
 		 504 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  32.14 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  35.22 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  32.64 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  35.26 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  32.89 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  37.25 
 
 		 658 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.47 
 
 		 519 aa  253  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.33 
 
 		 506 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.73 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.32 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  33.19 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  30.64 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  33.62 
 
 		 508 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  37.02 
 
 		 658 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  32.62 
 
 		 506 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  33.62 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  32.53 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.12 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  33.75 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  31.37 
 
 		 529 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  34.77 
 
 		 499 aa  246  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  32.03 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  33.86 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  31.92 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.38 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  33.69 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  34.22 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  31.98 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  31.98 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  31.35 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  32.1 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  32.1 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  35.03 
 
 		 508 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  34.59 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.24 
 
 		 531 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.16 
 
 		 509 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  32.6 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  33.04 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  32.72 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.43 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  33.79 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  32.82 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  31.31 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  32.74 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>