237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2001 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  71.35 
 
 		 520 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 514 aa  1013    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  86.63 
 
 		 516 aa  863    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  92.8 
 
 		 514 aa  939    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.03 
 
 		 503 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  43.88 
 
 		 503 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  43.06 
 
 		 658 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.21 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  43.27 
 
 		 658 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  38.76 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  42.07 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  38.28 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.97 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  39.96 
 
 		 500 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.01 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.96 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.06 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  38.7 
 
 		 529 aa  307  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  40.16 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  38.1 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  40.16 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  40.16 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  40.38 
 
 		 505 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  35.32 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  39 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  36.67 
 
 		 494 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.38 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  40.46 
 
 		 498 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  40.83 
 
 		 498 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  33.47 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.77 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.86 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  38.17 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  35.49 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  38.11 
 
 		 500 aa  283  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  38.88 
 
 		 499 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  37.69 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.06 
 
 		 497 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.8 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  34.67 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  34.67 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  34.67 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  34.67 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  36.03 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.01 
 
 		 536 aa  279  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.18 
 
 		 508 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.14 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  37.07 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  35.38 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.54 
 
 		 508 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.98 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  37.88 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  34.85 
 
 		 499 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  35.39 
 
 		 500 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  35.23 
 
 		 503 aa  273  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  36.56 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.7 
 
 		 500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.39 
 
 		 519 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  37.6 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  35.22 
 
 		 506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.7 
 
 		 500 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  35.02 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  37.24 
 
 		 501 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  35.43 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  35.9 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.71 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.2 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  34.82 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.78 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.82 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  34.82 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  34.82 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  36.19 
 
 		 503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.14 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  36.67 
 
 		 496 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  34.6 
 
 		 508 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  35.47 
 
 		 497 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.04 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  35.47 
 
 		 504 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  36.4 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  34.1 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  34.73 
 
 		 508 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  36 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  37.22 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  38.9 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  33.87 
 
 		 505 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  35.14 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  35.79 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.94 
 
 		 500 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.15 
 
 		 500 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  35.4 
 
 		 506 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  35.89 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  37.24 
 
 		 504 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  34.83 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  34.06 
 
 		 500 aa  261  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  36.5 
 
 		 494 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.28 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  37.76 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  34.86 
 
 		 500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.57 
 
 		 501 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>