237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4209 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  966    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  966    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  100 
 
 		 496 aa  966    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.76 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.34 
 
 		 491 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  45.59 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  40.12 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.18 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  41.08 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  38.83 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  42.77 
 
 		 500 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.81 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.68 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.78 
 
 		 502 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.21 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  38.68 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.81 
 
 		 508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  41.56 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  39.96 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  43.62 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  39.34 
 
 		 506 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.68 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  40.46 
 
 		 504 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  40.7 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  38.51 
 
 		 499 aa  332  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  38.74 
 
 		 515 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  37.45 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.16 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  38.13 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  38.63 
 
 		 508 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  38.13 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  38.13 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  38.13 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  38.13 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.73 
 
 		 519 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.96 
 
 		 516 aa  328  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  41.6 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  38.03 
 
 		 508 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.35 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  40.2 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.96 
 
 		 503 aa  326  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.76 
 
 		 505 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.45 
 
 		 536 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  44.23 
 
 		 498 aa  323  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  44.23 
 
 		 498 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.46 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  38.1 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.93 
 
 		 519 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.69 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.27 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.27 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.27 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.27 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  38.27 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  37.07 
 
 		 504 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  39.78 
 
 		 503 aa  319  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  39.03 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  37.32 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  38.13 
 
 		 529 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  39.48 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  36.86 
 
 		 504 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.11 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  36.71 
 
 		 504 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  36.51 
 
 		 504 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  37.32 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  40.72 
 
 		 508 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  36.76 
 
 		 506 aa  316  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  39.03 
 
 		 510 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  39.83 
 
 		 499 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  39.63 
 
 		 499 aa  315  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  40.12 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  38.79 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  39.96 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  35.76 
 
 		 504 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  35.5 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  41.41 
 
 		 500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  38.09 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  37.2 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  36.25 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  39.29 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  37.68 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  37.4 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  38.14 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  37.73 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  39.06 
 
 		 499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  35.45 
 
 		 507 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  38.16 
 
 		 504 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  35.73 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  36.1 
 
 		 512 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  37.68 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  35.85 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.64 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  36.53 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  42.8 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  38.32 
 
 		 506 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.09 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  37.83 
 
 		 515 aa  300  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  37.21 
 
 		 502 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  36.66 
 
 		 498 aa  299  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  37.63 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>