238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1753 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  998    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  57.78 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.22 
 
 
502 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  54.67 
 
 
499 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  55.49 
 
 
497 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  51.09 
 
 
505 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  52.07 
 
 
497 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  51.5 
 
 
494 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  38.48 
 
 
494 aa  336  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  37.87 
 
 
490 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0608  hypothetical protein  38.73 
 
 
487 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00222662  normal  0.0295774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.94 
 
 
493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  35.03 
 
 
498 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.28 
 
 
491 aa  305  9.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  36.92 
 
 
494 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  35.65 
 
 
506 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  38.16 
 
 
496 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  38.16 
 
 
496 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  38.16 
 
 
496 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.89 
 
 
503 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.17 
 
 
514 aa  289  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  38.69 
 
 
500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  35.53 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  33.47 
 
 
508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.8 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.69 
 
 
508 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  34.6 
 
 
506 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  34.68 
 
 
507 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  35.6 
 
 
499 aa  276  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  33.47 
 
 
508 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  32.19 
 
 
504 aa  272  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  32.93 
 
 
508 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.03 
 
 
497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  33.07 
 
 
509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  35.39 
 
 
512 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  33.6 
 
 
506 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.41 
 
 
509 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.11 
 
 
516 aa  269  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  32.94 
 
 
505 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  34.42 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  34.54 
 
 
658 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.76 
 
 
514 aa  267  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  35.12 
 
 
658 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  31.87 
 
 
502 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  36.88 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.64 
 
 
520 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  36.88 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  33.13 
 
 
504 aa  266  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  32.01 
 
 
502 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 
501 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  35.43 
 
 
496 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  34.24 
 
 
504 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.38 
 
 
508 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  33.33 
 
 
509 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.84 
 
 
501 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  32.6 
 
 
509 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.53 
 
 
506 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  33.48 
 
 
499 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  34.13 
 
 
506 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  34.13 
 
 
506 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  34.13 
 
 
506 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.13 
 
 
506 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  31.44 
 
 
502 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.6 
 
 
506 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  31.99 
 
 
500 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  32.93 
 
 
508 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  31.36 
 
 
500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  31.24 
 
 
509 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.88 
 
 
504 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  32.41 
 
 
503 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.47 
 
 
519 aa  257  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  31.73 
 
 
500 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  31.69 
 
 
500 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  35.2 
 
 
529 aa  256  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.13 
 
 
500 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  34.6 
 
 
502 aa  256  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.34 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.21 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.41 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.26 
 
 
509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  35.77 
 
 
502 aa  254  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  33.71 
 
 
501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.13 
 
 
500 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  33.26 
 
 
505 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  33.26 
 
 
505 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  33.4 
 
 
502 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.93 
 
 
500 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.61 
 
 
503 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  31.56 
 
 
508 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.29 
 
 
519 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  32.4 
 
 
502 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  33.05 
 
 
503 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  31.81 
 
 
504 aa  250  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  31.61 
 
 
503 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  31.89 
 
 
512 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.55 
 
 
531 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  32.32 
 
 
500 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  32.84 
 
 
500 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  33.27 
 
 
508 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.27 
 
 
511 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>