237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0608 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  946    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00222662  normal  0.0295774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  44.19 
 
 		 505 aa  347  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  40.82 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  38.68 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  42.47 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  41.05 
 
 		 499 aa  326  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.73 
 
 		 502 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  38.49 
 
 		 497 aa  312  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  39.26 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  33.12 
 
 		 490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.54 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  33.83 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  32.09 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.51 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.93 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.37 
 
 		 514 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  34.72 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  35.44 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  32.83 
 
 		 507 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  29.1 
 
 		 502 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  33.48 
 
 		 506 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.85 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  31.84 
 
 		 498 aa  213  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  32.92 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.46 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 		 496 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  32.98 
 
 		 496 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  32.98 
 
 		 496 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  30.2 
 
 		 506 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  30.2 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.2 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  30.6 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  30.2 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  30.2 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  32.82 
 
 		 658 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  31.32 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  29.66 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  31.7 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  32.46 
 
 		 658 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  31.07 
 
 		 502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.67 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  32.25 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.63 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  29.92 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  34.44 
 
 		 529 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  31.51 
 
 		 512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  29.39 
 
 		 508 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.9 
 
 		 503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.21 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.29 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  31.79 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  31.87 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  31.76 
 
 		 508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  31.37 
 
 		 499 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  31.7 
 
 		 505 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  30.66 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  29.6 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.04 
 
 		 536 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.58 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  32.24 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.01 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  29.25 
 
 		 500 aa  193  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  29 
 
 		 509 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  29.35 
 
 		 500 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.3 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  29.12 
 
 		 502 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  29.78 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  29.78 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  30.62 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  30.14 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  30.62 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  30.62 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  32.98 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  30.62 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  30.49 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  30.62 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.33 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  28.14 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.99 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  29.08 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  29.47 
 
 		 503 aa  187  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  31.33 
 
 		 503 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  28.77 
 
 		 500 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  28.92 
 
 		 508 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  28.78 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.73 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.64 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  30.24 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.83 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  29.64 
 
 		 506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  28.63 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  29.28 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  29.66 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  29.46 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  28.31 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  30.19 
 
 		 502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  31.08 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.74 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>