237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3933 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  986    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  35.87 
 
 
494 aa  326  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  38.46 
 
 
490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.39 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.19 
 
 
508 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  37.79 
 
 
500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  34.84 
 
 
494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.74 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  35.31 
 
 
502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  35.84 
 
 
508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  34.58 
 
 
506 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  33.73 
 
 
498 aa  281  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  34.83 
 
 
509 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.25 
 
 
508 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  35.53 
 
 
500 aa  280  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  35.73 
 
 
506 aa  280  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  35.45 
 
 
509 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  35.04 
 
 
498 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.38 
 
 
500 aa  276  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  34.19 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  34.19 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  34.19 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  33.55 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  34.97 
 
 
504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  35.1 
 
 
504 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  34.59 
 
 
504 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.77 
 
 
508 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  33.13 
 
 
504 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.4 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.4 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.13 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.4 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  34.79 
 
 
504 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  34.39 
 
 
504 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  32.93 
 
 
504 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  32.93 
 
 
504 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  32.93 
 
 
504 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  33.61 
 
 
507 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  32.93 
 
 
504 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  34.39 
 
 
504 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  34.59 
 
 
504 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  32.22 
 
 
506 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  34.19 
 
 
504 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.2 
 
 
506 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  34.58 
 
 
497 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.79 
 
 
509 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  34.71 
 
 
499 aa  266  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.85 
 
 
497 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.34 
 
 
519 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  34.75 
 
 
501 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  33.92 
 
 
506 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  34.06 
 
 
502 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  33.26 
 
 
503 aa  264  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 
502 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  33.12 
 
 
500 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  33.68 
 
 
499 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.12 
 
 
536 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  34.48 
 
 
505 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  33.81 
 
 
503 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  30.5 
 
 
509 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.98 
 
 
536 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3487  hypothetical protein  35.73 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.812396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  32.94 
 
 
504 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 
503 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.99 
 
 
503 aa  259  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.07 
 
 
504 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  33.61 
 
 
505 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  35.55 
 
 
501 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  32.72 
 
 
512 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  32.27 
 
 
500 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  33.07 
 
 
504 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  34.12 
 
 
497 aa  257  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.86 
 
 
501 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  34.93 
 
 
499 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  32.57 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.47 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  34.58 
 
 
506 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  32.47 
 
 
501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.86 
 
 
501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  32.01 
 
 
505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.06 
 
 
506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.98 
 
 
506 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  32.01 
 
 
499 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.58 
 
 
503 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 
520 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3183  hypothetical protein  34.93 
 
 
494 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.01 
 
 
502 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  33.7 
 
 
505 aa  252  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.5 
 
 
509 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  32.75 
 
 
502 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  33.47 
 
 
504 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  34.01 
 
 
497 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.98 
 
 
504 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  34.43 
 
 
500 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.41 
 
 
500 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  34.24 
 
 
505 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.73 
 
 
505 aa  251  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  34.8 
 
 
508 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 
514 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>