237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3487 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3487  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  984    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.812396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3121  protein of unknown function DUF112 transmembrane  82.48 
 
 
505 aa  776    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0986619  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2730  hypothetical protein  85.83 
 
 
506 aa  776    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346566  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  58.25 
 
 
508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.51 
 
 
506 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  57.51 
 
 
506 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  57.03 
 
 
508 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  57.51 
 
 
506 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  57.51 
 
 
506 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  57.11 
 
 
508 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  57.51 
 
 
506 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  57.31 
 
 
506 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  56.75 
 
 
509 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  57.87 
 
 
509 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.51 
 
 
503 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  42.43 
 
 
504 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  43.06 
 
 
504 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.63 
 
 
504 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  42.23 
 
 
504 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.83 
 
 
500 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  42.43 
 
 
504 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.93 
 
 
508 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  43.79 
 
 
506 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  41.8 
 
 
504 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  41.45 
 
 
504 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  41.03 
 
 
506 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  46.15 
 
 
495 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  42.83 
 
 
500 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  40.85 
 
 
500 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  40.95 
 
 
504 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  40.95 
 
 
504 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  40.95 
 
 
504 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  42.41 
 
 
500 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41 
 
 
504 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  40.95 
 
 
504 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  42.17 
 
 
508 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.32 
 
 
505 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  42.43 
 
 
500 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.6 
 
 
504 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  43.6 
 
 
505 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.64 
 
 
536 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  40.23 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.72 
 
 
519 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  41.78 
 
 
505 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  41.67 
 
 
500 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  40.16 
 
 
500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  42.11 
 
 
500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  39.88 
 
 
500 aa  352  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.92 
 
 
497 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  41.07 
 
 
496 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  40.67 
 
 
506 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.3 
 
 
503 aa  347  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  40.64 
 
 
503 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  40.35 
 
 
503 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  40.52 
 
 
512 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  40.88 
 
 
503 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.23 
 
 
503 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.84 
 
 
500 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  41.51 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.82 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  39.7 
 
 
507 aa  339  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.8 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  41.04 
 
 
501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  40.94 
 
 
503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  41.03 
 
 
502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  42.74 
 
 
502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43 
 
 
501 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  41.3 
 
 
499 aa  336  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  43.86 
 
 
505 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  39.36 
 
 
505 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.69 
 
 
502 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.84 
 
 
501 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  45.19 
 
 
502 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  43.86 
 
 
505 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  40.94 
 
 
504 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  41.91 
 
 
498 aa  334  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  39.69 
 
 
502 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  40.95 
 
 
504 aa  333  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.92 
 
 
504 aa  333  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  41.43 
 
 
502 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  41.25 
 
 
503 aa  333  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  41.48 
 
 
502 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  39.96 
 
 
503 aa  332  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  43.25 
 
 
501 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  41.19 
 
 
504 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  40.88 
 
 
504 aa  329  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.76 
 
 
536 aa  329  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.97 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  38.16 
 
 
509 aa  326  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  39.6 
 
 
503 aa  326  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  40.32 
 
 
505 aa  325  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.54 
 
 
506 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  42.06 
 
 
500 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  41.6 
 
 
504 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.72 
 
 
497 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  40.64 
 
 
503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.16 
 
 
509 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  40.82 
 
 
515 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  36.31 
 
 
513 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  38.41 
 
 
504 aa  317  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>