237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3183 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3183  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  969    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  48.17 
 
 
539 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3508  hypothetical protein  46.33 
 
 
496 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0428197  decreased coverage  0.0000798932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  35.23 
 
 
490 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  32.84 
 
 
494 aa  287  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.05 
 
 
493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  33.75 
 
 
502 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  34.89 
 
 
505 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.5 
 
 
536 aa  281  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  34.14 
 
 
502 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  34.9 
 
 
506 aa  275  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  35.17 
 
 
500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.97 
 
 
503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  34.82 
 
 
500 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.81 
 
 
502 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  35.7 
 
 
500 aa  273  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.2 
 
 
504 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  33.27 
 
 
500 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  34.88 
 
 
500 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  36.16 
 
 
504 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  34.66 
 
 
499 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  33.13 
 
 
512 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.32 
 
 
508 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  37.27 
 
 
504 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  32.91 
 
 
504 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  34.26 
 
 
498 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.12 
 
 
508 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.22 
 
 
497 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  36.83 
 
 
506 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  35.29 
 
 
494 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.89 
 
 
519 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  32.99 
 
 
505 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  34.98 
 
 
504 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  34.98 
 
 
504 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  34.71 
 
 
504 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  34.71 
 
 
504 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.98 
 
 
504 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  35.38 
 
 
506 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.6 
 
 
500 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  35.44 
 
 
500 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  35.6 
 
 
506 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  30.97 
 
 
505 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.15 
 
 
500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.03 
 
 
503 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  32.32 
 
 
502 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  32.31 
 
 
508 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.88 
 
 
500 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  35.31 
 
 
500 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  32.35 
 
 
503 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  34.74 
 
 
503 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.18 
 
 
536 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.76 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  31.6 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  31.85 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  34.16 
 
 
504 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  34.57 
 
 
504 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.3 
 
 
505 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  34.38 
 
 
504 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  34.93 
 
 
505 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  31.63 
 
 
500 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  33.4 
 
 
503 aa  253  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.31 
 
 
509 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  33.4 
 
 
504 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  35.85 
 
 
508 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.77 
 
 
500 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  32.75 
 
 
505 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  31.33 
 
 
506 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  31.33 
 
 
506 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.33 
 
 
506 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.6 
 
 
501 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  31.33 
 
 
506 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.1 
 
 
501 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  33.74 
 
 
504 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  32.64 
 
 
509 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.21 
 
 
501 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  31.33 
 
 
506 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  32.21 
 
 
501 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  34.45 
 
 
500 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  35.73 
 
 
500 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  36.4 
 
 
510 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  31.12 
 
 
506 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.1 
 
 
500 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  33.96 
 
 
504 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.11 
 
 
503 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  37.03 
 
 
510 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  34.13 
 
 
501 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  32.91 
 
 
502 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  33.82 
 
 
504 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  33.4 
 
 
515 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  35.31 
 
 
508 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  33.68 
 
 
505 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  37.13 
 
 
509 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.11 
 
 
504 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  31.67 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  35.65 
 
 
495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  32.26 
 
 
503 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  32.85 
 
 
508 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  38.44 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  33.2 
 
 
504 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  32.08 
 
 
503 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>