237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2397 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  970    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.08 
 
 
493 aa  355  8.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  38.39 
 
 
494 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  39.33 
 
 
490 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  38.7 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  40.31 
 
 
500 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  40.04 
 
 
502 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  39.16 
 
 
500 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  40.31 
 
 
500 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  40 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.2 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.04 
 
 
519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  38.68 
 
 
507 aa  326  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  39.84 
 
 
494 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  38.51 
 
 
508 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  35.96 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  39.62 
 
 
500 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  38.54 
 
 
512 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.71 
 
 
500 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  37.09 
 
 
504 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.79 
 
 
500 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  41.51 
 
 
498 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.36 
 
 
504 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.78 
 
 
500 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  36.36 
 
 
504 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  36.36 
 
 
504 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  36.16 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  36.16 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  39.27 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  37.96 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  41.63 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  38.23 
 
 
505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.72 
 
 
503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  40.93 
 
 
500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  40.38 
 
 
504 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.98 
 
 
508 aa  313  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  38.78 
 
 
500 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  38.77 
 
 
503 aa  313  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  37.76 
 
 
504 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  38.84 
 
 
500 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  37.03 
 
 
504 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.11 
 
 
503 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  37.63 
 
 
504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  40.27 
 
 
506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  38.27 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  37.34 
 
 
504 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  37.34 
 
 
504 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.25 
 
 
505 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.22 
 
 
504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  39.19 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  37.37 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  37.37 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  37.37 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  37.37 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.22 
 
 
536 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  39.83 
 
 
496 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  39.83 
 
 
496 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  39.09 
 
 
499 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  39.83 
 
 
496 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  38.68 
 
 
502 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.68 
 
 
516 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  37.58 
 
 
506 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  36.55 
 
 
504 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  37.01 
 
 
504 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.13 
 
 
514 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.6 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  37.13 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  38.33 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  38.55 
 
 
503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  35.86 
 
 
505 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  38.21 
 
 
500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  37 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.05 
 
 
497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.79 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.7 
 
 
519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  36.81 
 
 
505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  38.06 
 
 
503 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.69 
 
 
520 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.49 
 
 
508 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  36.33 
 
 
506 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.25 
 
 
504 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  35.43 
 
 
508 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.73 
 
 
491 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  35.09 
 
 
509 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  36.64 
 
 
502 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.55 
 
 
506 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.08 
 
 
514 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.61 
 
 
497 aa  299  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  39.61 
 
 
503 aa  299  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  37.75 
 
 
499 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.46 
 
 
506 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36 
 
 
515 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  36.48 
 
 
505 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  36.09 
 
 
503 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  36.65 
 
 
495 aa  296  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.43 
 
 
508 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  36.4 
 
 
529 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.78 
 
 
503 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  37.39 
 
 
501 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>