240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0300 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
491 aa  944    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  40.77 
 
 
494 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  41.65 
 
 
490 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.45 
 
 
493 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  48.46 
 
 
496 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.09 
 
 
497 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  48.46 
 
 
496 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.16 
 
 
503 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  48.46 
 
 
496 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  40.04 
 
 
498 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  41.99 
 
 
494 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.18 
 
 
506 aa  363  4e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  40.61 
 
 
506 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  40.64 
 
 
502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.56 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  45.63 
 
 
498 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40 
 
 
502 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  45.63 
 
 
498 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  42.13 
 
 
500 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  40.33 
 
 
502 aa  348  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  42.38 
 
 
500 aa  348  9e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  38.59 
 
 
508 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.96 
 
 
503 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  38.48 
 
 
504 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  39.55 
 
 
500 aa  342  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  37.15 
 
 
508 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.71 
 
 
519 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  38.4 
 
 
505 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  41.07 
 
 
515 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.67 
 
 
514 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  37.31 
 
 
507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  38.84 
 
 
500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  38.56 
 
 
504 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  38.56 
 
 
504 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  38.56 
 
 
504 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  38.56 
 
 
504 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  38.56 
 
 
504 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  37.37 
 
 
500 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  37.93 
 
 
504 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  37.1 
 
 
519 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  38.82 
 
 
506 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.6 
 
 
500 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  37.66 
 
 
500 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.07 
 
 
516 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.42 
 
 
514 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  38.68 
 
 
505 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  39.75 
 
 
508 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.54 
 
 
509 aa  329  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.56 
 
 
500 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  38.17 
 
 
506 aa  328  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  38.88 
 
 
509 aa  328  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  38.51 
 
 
506 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.22 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.55 
 
 
504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  37.58 
 
 
503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  40.17 
 
 
512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  37.9 
 
 
506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  38.16 
 
 
502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  39.55 
 
 
508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  37.52 
 
 
506 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.52 
 
 
506 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  37.52 
 
 
506 aa  326  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  37.52 
 
 
506 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  37.52 
 
 
506 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  40.93 
 
 
508 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.98 
 
 
500 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  39.87 
 
 
505 aa  325  9e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  38.28 
 
 
504 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  37.86 
 
 
500 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  38.4 
 
 
500 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.87 
 
 
515 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  41.04 
 
 
499 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  40.56 
 
 
502 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  36.67 
 
 
500 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  37.8 
 
 
504 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.85 
 
 
504 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  38.98 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  39.75 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.19 
 
 
505 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.06 
 
 
536 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  39.1 
 
 
505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  37.4 
 
 
504 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  36.73 
 
 
490 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  37.4 
 
 
504 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.62 
 
 
501 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  38.01 
 
 
504 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  38.08 
 
 
498 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.36 
 
 
536 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  37.32 
 
 
504 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  37.99 
 
 
503 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  36.76 
 
 
504 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.82 
 
 
497 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  36.16 
 
 
512 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.25 
 
 
531 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.04 
 
 
500 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.59 
 
 
520 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  38.39 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.43 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  36.99 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.73 
 
 
508 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>