237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0289 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  980    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  63.23 
 
 
499 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.62 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  39.75 
 
 
494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  40.04 
 
 
498 aa  335  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  38.39 
 
 
507 aa  326  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  40.28 
 
 
490 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  38.61 
 
 
500 aa  322  8e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  40.46 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.91 
 
 
536 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.5 
 
 
502 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  41.03 
 
 
498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  41.03 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.16 
 
 
519 aa  309  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  35.79 
 
 
506 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  35.79 
 
 
506 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  35.79 
 
 
506 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  35.79 
 
 
506 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.79 
 
 
506 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  37.53 
 
 
500 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.14 
 
 
506 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.18 
 
 
536 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  37.5 
 
 
496 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.66 
 
 
502 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  36.31 
 
 
505 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  37.95 
 
 
500 aa  299  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  37.31 
 
 
500 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.82 
 
 
503 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.82 
 
 
497 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  35.56 
 
 
506 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  36.44 
 
 
504 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  35.19 
 
 
506 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.89 
 
 
503 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  36.38 
 
 
501 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  37.26 
 
 
502 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  36.65 
 
 
505 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  34.64 
 
 
497 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.76 
 
 
504 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  34.76 
 
 
504 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  34.76 
 
 
504 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.47 
 
 
504 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  34.56 
 
 
504 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  34.56 
 
 
504 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.17 
 
 
501 aa  293  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  35.26 
 
 
504 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  36.11 
 
 
500 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.92 
 
 
502 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.27 
 
 
504 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  36.08 
 
 
508 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.32 
 
 
509 aa  291  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  35.46 
 
 
499 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  37.61 
 
 
506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  35.36 
 
 
502 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  40.94 
 
 
496 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  40.94 
 
 
496 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  40.94 
 
 
496 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  35.34 
 
 
506 aa  289  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  35.2 
 
 
504 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  35.13 
 
 
504 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  36.98 
 
 
494 aa  288  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  35.2 
 
 
504 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.07 
 
 
500 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  34.79 
 
 
504 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  36.13 
 
 
506 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.11 
 
 
501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  35.63 
 
 
503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  36.03 
 
 
497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  35.17 
 
 
504 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  36.97 
 
 
500 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  37.16 
 
 
504 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  37.95 
 
 
504 aa  286  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.92 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  35.45 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  37.64 
 
 
512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.72 
 
 
500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  35.85 
 
 
501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.72 
 
 
500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.12 
 
 
508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  33.27 
 
 
508 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.09 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  33.94 
 
 
509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  37.52 
 
 
503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  36.11 
 
 
500 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  36.26 
 
 
505 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  37.64 
 
 
529 aa  283  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  37.97 
 
 
503 aa  283  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  36.97 
 
 
498 aa  282  9e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  36.89 
 
 
658 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  36.05 
 
 
500 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.01 
 
 
508 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  36.67 
 
 
658 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  35.82 
 
 
503 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  36.07 
 
 
508 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  36.3 
 
 
504 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  37.17 
 
 
502 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  34.35 
 
 
508 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  35.36 
 
 
503 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  37.09 
 
 
512 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.11 
 
 
491 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  37.25 
 
 
497 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>