238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2448 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  983    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  44.88 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  40.5 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.6 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.42 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  41.72 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  42.17 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.76 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.05 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  38.88 
 
 		 502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  38.35 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  41.08 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  41.08 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.82 
 
 		 491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  41.08 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  42.52 
 
 		 498 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  42.52 
 
 		 498 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  41.36 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.68 
 
 		 519 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.78 
 
 		 514 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.12 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  40.04 
 
 		 499 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.25 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.92 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  40.12 
 
 		 506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  36.75 
 
 		 504 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  36.75 
 
 		 504 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  36.75 
 
 		 504 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.47 
 
 		 536 aa  325  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  36.75 
 
 		 504 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.03 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  38.35 
 
 		 508 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.69 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.87 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.05 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  38.77 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  37.58 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.14 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  35.99 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  36.14 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  40.2 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  38.12 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  38.49 
 
 		 505 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  38.7 
 
 		 499 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  39.88 
 
 		 504 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  36.92 
 
 		 509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  40.2 
 
 		 510 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  37.77 
 
 		 658 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  35.46 
 
 		 498 aa  310  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  38.29 
 
 		 658 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.22 
 
 		 497 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 		 506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  36.07 
 
 		 512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  40.54 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.63 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.84 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.6 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  38.66 
 
 		 504 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.71 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  36.62 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  34.13 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  39.29 
 
 		 500 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.16 
 
 		 502 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  38.25 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.14 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  38.25 
 
 		 506 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.74 
 
 		 515 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.4 
 
 		 505 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  32.84 
 
 		 507 aa  300  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  39.79 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  35.03 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  37.9 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.47 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  36.78 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  34.61 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.17 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.11 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.4 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  33.9 
 
 		 529 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  42.06 
 
 		 508 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  34.42 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  38.03 
 
 		 512 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  37.67 
 
 		 505 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  33.95 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  34.51 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  34.39 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  36.36 
 
 		 506 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  34.54 
 
 		 508 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.99 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  33.4 
 
 		 504 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  39.46 
 
 		 499 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  37.19 
 
 		 502 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  33.4 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  33.68 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  34.27 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  37.33 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  32.99 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  35.08 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  36.61 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  32.99 
 
 		 505 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>