237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4226 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  998    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  87.67 
 
 		 509 aa  889    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  66.6 
 
 		 506 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  67.34 
 
 		 506 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  61.45 
 
 		 508 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  61.32 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  58.06 
 
 		 506 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  60 
 
 		 504 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.83 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  61.52 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  59.84 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  59.65 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  60.96 
 
 		 499 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  56.77 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.78 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.86 
 
 		 503 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  39.52 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  40.86 
 
 		 506 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.66 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  37.57 
 
 		 504 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  37.57 
 
 		 504 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  37.57 
 
 		 504 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  37.45 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.89 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  37.38 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  37.65 
 
 		 508 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  37.38 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.7 
 
 		 519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  39.45 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  39.64 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  40.16 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  39.96 
 
 		 504 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  37.67 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.67 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  37.7 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  37.67 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  37.67 
 
 		 506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  37.67 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  39.55 
 
 		 504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  37.45 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  39.25 
 
 		 504 aa  336  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  38.82 
 
 		 504 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.12 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  36.86 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  40 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.49 
 
 		 505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  38.52 
 
 		 501 aa  329  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.39 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.72 
 
 		 536 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  37.82 
 
 		 505 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.96 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.11 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.64 
 
 		 508 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  37.93 
 
 		 505 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.53 
 
 		 503 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.31 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.5 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.25 
 
 		 504 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.1 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  38.1 
 
 		 503 aa  315  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  36.92 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.47 
 
 		 494 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  36.92 
 
 		 505 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  38.01 
 
 		 503 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  39.84 
 
 		 500 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  37.5 
 
 		 500 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  40.68 
 
 		 505 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  40.68 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  36.59 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  37.26 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  37.32 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  36.69 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  39.63 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  37.05 
 
 		 500 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  36.33 
 
 		 508 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.87 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.62 
 
 		 508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.13 
 
 		 519 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  38.2 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  37.39 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  34.81 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  36.02 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  34.89 
 
 		 529 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34.06 
 
 		 531 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  36.24 
 
 		 500 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  35.84 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.84 
 
 		 501 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  40.8 
 
 		 502 aa  299  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.34 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  37.1 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  36.15 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  36.63 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  37.21 
 
 		 496 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  37.53 
 
 		 500 aa  296  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  35.76 
 
 		 498 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  34.33 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.51 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.67 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>