237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2059 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
497 aa  975    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  38.98 
 
 
503 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  38.18 
 
 
676 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  39.63 
 
 
648 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  35.84 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  39.63 
 
 
500 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.22 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1910  hypothetical protein  37.42 
 
 
653 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0703624  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  35.56 
 
 
490 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.24 
 
 
502 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0165  hypothetical protein  36.03 
 
 
649 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.27 
 
 
506 aa  277  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  35.68 
 
 
658 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  35.84 
 
 
529 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  35.9 
 
 
658 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36 
 
 
503 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  34.58 
 
 
512 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  34.58 
 
 
501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.58 
 
 
501 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.38 
 
 
497 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  35.73 
 
 
506 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.02 
 
 
536 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  32.68 
 
 
508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.19 
 
 
519 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  34.64 
 
 
494 aa  267  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  34.83 
 
 
500 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.68 
 
 
504 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  34.98 
 
 
506 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.98 
 
 
506 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  34.98 
 
 
506 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  34.98 
 
 
506 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  34.98 
 
 
506 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  35.06 
 
 
503 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  33.68 
 
 
504 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  34.29 
 
 
500 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  32.65 
 
 
500 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.88 
 
 
500 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  33.81 
 
 
500 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  34.59 
 
 
506 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  36.86 
 
 
498 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  36.86 
 
 
498 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  35.21 
 
 
504 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.83 
 
 
503 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  35.38 
 
 
504 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.67 
 
 
500 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  37.27 
 
 
508 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  34.13 
 
 
506 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  32.96 
 
 
507 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.98 
 
 
536 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  34.63 
 
 
539 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.19 
 
 
504 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.96 
 
 
508 aa  256  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.88 
 
 
509 aa  256  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  33.67 
 
 
500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  33.33 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  34.19 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  32.78 
 
 
505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  31.82 
 
 
508 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.6 
 
 
514 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.92 
 
 
493 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  34.21 
 
 
500 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  31.38 
 
 
502 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  34.53 
 
 
496 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  32.72 
 
 
502 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  34.53 
 
 
496 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  34.53 
 
 
496 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3508  hypothetical protein  33.06 
 
 
496 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0428197  decreased coverage  0.0000798932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 
508 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  31.26 
 
 
499 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  33.63 
 
 
503 aa  250  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  33.47 
 
 
500 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.59 
 
 
514 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  32.14 
 
 
509 aa  249  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  32.8 
 
 
508 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.19 
 
 
503 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  34.19 
 
 
503 aa  249  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  34.51 
 
 
502 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  36.34 
 
 
500 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  33.27 
 
 
496 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.42 
 
 
500 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  33.19 
 
 
508 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  32.37 
 
 
500 aa  248  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  33.54 
 
 
490 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  35.79 
 
 
499 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  32.11 
 
 
515 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  33.13 
 
 
509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  35.7 
 
 
510 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  35.7 
 
 
510 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  32.65 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  33.71 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  32.72 
 
 
504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  32.72 
 
 
504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  32.14 
 
 
508 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  32.72 
 
 
504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  32.72 
 
 
504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  32.92 
 
 
504 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.88 
 
 
516 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  34.35 
 
 
503 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  33.61 
 
 
505 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>