237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1910 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0165  hypothetical protein  58.11 
 
 
649 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1910  hypothetical protein  100 
 
 
653 aa  1280    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0703624  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  52.84 
 
 
648 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  42.77 
 
 
676 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  38.38 
 
 
503 aa  328  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.89 
 
 
497 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  35.48 
 
 
482 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  32.39 
 
 
494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  31.94 
 
 
508 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  35.67 
 
 
500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.7 
 
 
506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.26 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.26 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.26 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.26 
 
 
506 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  35.2 
 
 
508 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.45 
 
 
508 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.43 
 
 
500 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.3 
 
 
506 aa  228  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  29.74 
 
 
493 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.95 
 
 
519 aa  227  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  30.75 
 
 
507 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  31.15 
 
 
509 aa  226  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  29.44 
 
 
498 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  32.59 
 
 
509 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  31.42 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  30.91 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  31.28 
 
 
512 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3487  hypothetical protein  31.55 
 
 
508 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.812396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.55 
 
 
502 aa  219  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.37 
 
 
536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  31.58 
 
 
504 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  31.58 
 
 
504 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 
496 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  31.58 
 
 
504 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  32.99 
 
 
496 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  31.58 
 
 
504 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  32.99 
 
 
496 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.98 
 
 
503 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  31.38 
 
 
504 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2730  hypothetical protein  32.54 
 
 
506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346566  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  32.87 
 
 
499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  31.03 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3121  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.13 
 
 
505 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0986619  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  31.39 
 
 
506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  31.82 
 
 
506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  32.38 
 
 
506 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  32.66 
 
 
512 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  31.64 
 
 
503 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  32.96 
 
 
500 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.84 
 
 
503 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.01 
 
 
520 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  30.79 
 
 
500 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  32.97 
 
 
506 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.68 
 
 
504 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  31.5 
 
 
504 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  32.27 
 
 
504 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.8 
 
 
536 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  31.24 
 
 
505 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  30 
 
 
519 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.21 
 
 
500 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  30.46 
 
 
498 aa  207  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  31.01 
 
 
504 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  32.54 
 
 
502 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.39 
 
 
504 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  31.62 
 
 
500 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.66 
 
 
503 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  32.68 
 
 
500 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.25 
 
 
500 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.65 
 
 
509 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  34.04 
 
 
658 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  34.98 
 
 
502 aa  205  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  32.98 
 
 
658 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  30.18 
 
 
504 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  29.84 
 
 
514 aa  204  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.44 
 
 
514 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  28.28 
 
 
508 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  34.32 
 
 
503 aa  203  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  33.49 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  32.42 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  31.84 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  29.77 
 
 
504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  31.84 
 
 
500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.71 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  30.08 
 
 
506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  32.8 
 
 
510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  29.57 
 
 
504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 
497 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  30.77 
 
 
502 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  32.51 
 
 
515 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  31.81 
 
 
503 aa  200  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.87 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  29.68 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  29.6 
 
 
496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  31.99 
 
 
529 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.83 
 
 
491 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  30.66 
 
 
506 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  29.11 
 
 
500 aa  198  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  31.35 
 
 
508 aa  198  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>