237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3579 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0165  hypothetical protein  55.78 
 
 		 649 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1244    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1910  hypothetical protein  52.69 
 
 		 653 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0703624  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  42.91 
 
 		 676 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  40.17 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.62 
 
 		 497 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  37.98 
 
 		 482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  35.07 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  35.11 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  32.57 
 
 		 494 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  35.29 
 
 		 506 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  35.51 
 
 		 506 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.68 
 
 		 502 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.67 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.04 
 
 		 506 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  32.83 
 
 		 506 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  31.87 
 
 		 490 aa  243  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  32.61 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  32.61 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.61 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  32.61 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  36.18 
 
 		 512 aa  242  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.59 
 
 		 519 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.7 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.73 
 
 		 506 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.14 
 
 		 503 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  33.41 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  31.65 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  31.73 
 
 		 512 aa  234  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  33.98 
 
 		 506 aa  234  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  35.9 
 
 		 503 aa  233  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  34 
 
 		 506 aa  232  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  32.53 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  31.84 
 
 		 508 aa  231  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  33.92 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  33.92 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  33.92 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  35.42 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  34.37 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  33.41 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.87 
 
 		 493 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  32.63 
 
 		 508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  32.27 
 
 		 509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  30.83 
 
 		 658 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  32.99 
 
 		 502 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  34.02 
 
 		 504 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.91 
 
 		 503 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  33.56 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  33.56 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  33.56 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  34.28 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  33.56 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  33.56 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  34.06 
 
 		 494 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  34.06 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  31.58 
 
 		 499 aa  225  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  33.48 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  34.06 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  33.48 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  33.63 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  32.23 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  34.06 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.6 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.05 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  33.62 
 
 		 503 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.18 
 
 		 514 aa  223  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  31.09 
 
 		 658 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 505 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 		 501 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.72 
 
 		 504 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  33.85 
 
 		 504 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  31.14 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  31.86 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  31.42 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.24 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  32.25 
 
 		 504 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  32.83 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.48 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  31.74 
 
 		 508 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  32.27 
 
 		 508 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  33.26 
 
 		 504 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  33.92 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.55 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.89 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  33.85 
 
 		 503 aa  219  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  32.04 
 
 		 508 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  33.12 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  32.67 
 
 		 504 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.63 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  32.47 
 
 		 496 aa  218  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  32.59 
 
 		 504 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  31.81 
 
 		 509 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  35.44 
 
 		 498 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  35.44 
 
 		 498 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  32.52 
 
 		 495 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.89 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.05 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>