237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1768 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  971    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  66.53 
 
 		 658 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  66.73 
 
 		 658 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.84 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.81 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.19 
 
 		 514 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.2 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.8 
 
 		 509 aa  347  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  41.75 
 
 		 529 aa  346  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  39.05 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.16 
 
 		 520 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  41.53 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  39.3 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  38.93 
 
 		 504 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  38.93 
 
 		 504 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  38.93 
 
 		 504 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  38.93 
 
 		 504 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  38.26 
 
 		 504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.55 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  36.12 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  37.52 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  36.22 
 
 		 504 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  42.46 
 
 		 498 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  42.54 
 
 		 498 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.97 
 
 		 506 aa  299  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.22 
 
 		 502 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  38.13 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  36.67 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  38.38 
 
 		 508 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  35.83 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  35.83 
 
 		 504 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.82 
 
 		 491 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.49 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  35.63 
 
 		 504 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  37.18 
 
 		 497 aa  292  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  34.88 
 
 		 504 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.67 
 
 		 505 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  34.1 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.06 
 
 		 497 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.03 
 
 		 508 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.91 
 
 		 503 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.72 
 
 		 500 aa  286  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.14 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.31 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.06 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  34.84 
 
 		 499 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  33.91 
 
 		 504 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  38.64 
 
 		 505 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.66 
 
 		 536 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  34.69 
 
 		 507 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  39.79 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  39.79 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  39.79 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  36.85 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.16 
 
 		 536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.44 
 
 		 508 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.33 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  34.33 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  34.33 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  34.33 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  34.33 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  35.17 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  36.13 
 
 		 504 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  38.07 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  36.5 
 
 		 494 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  35.86 
 
 		 500 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  34.14 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  35.44 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  35.69 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  35.23 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.94 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  34.13 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  35.05 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  34.56 
 
 		 500 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  34.64 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  35.68 
 
 		 498 aa  264  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.01 
 
 		 503 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  33.87 
 
 		 505 aa  264  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  32.04 
 
 		 508 aa  263  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  33.14 
 
 		 504 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  35.71 
 
 		 499 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  31.73 
 
 		 506 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  36.49 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.12 
 
 		 508 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  35 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  35.28 
 
 		 503 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  35.18 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  37.04 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  35.59 
 
 		 500 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  36.21 
 
 		 506 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  36.8 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.86 
 
 		 500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  36.21 
 
 		 506 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.67 
 
 		 504 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  36.58 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.85 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  34.68 
 
 		 505 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  35.1 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.62 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>