237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4415 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
503 aa  974    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.03 
 
 
514 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.76 
 
 
520 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.64 
 
 
514 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.83 
 
 
516 aa  579  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  45.84 
 
 
503 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  41.75 
 
 
490 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  43.62 
 
 
500 aa  358  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  43.47 
 
 
658 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  41.43 
 
 
494 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  43.67 
 
 
658 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.52 
 
 
493 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  41.18 
 
 
529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.39 
 
 
509 aa  333  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.37 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  37.98 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.2 
 
 
503 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.4 
 
 
506 aa  325  9e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  36.66 
 
 
499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  38.28 
 
 
505 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.79 
 
 
491 aa  310  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  38.31 
 
 
505 aa  309  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  39.14 
 
 
497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  40.32 
 
 
498 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  38.37 
 
 
506 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  39.44 
 
 
506 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  40.64 
 
 
498 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.9 
 
 
502 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  36.6 
 
 
494 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  42.42 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  42.42 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  38.84 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.7 
 
 
508 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  37.11 
 
 
504 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.08 
 
 
497 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  37.78 
 
 
505 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  37.71 
 
 
499 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  35.06 
 
 
504 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  39 
 
 
506 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  35.06 
 
 
504 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  35.06 
 
 
504 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  39.7 
 
 
508 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  35.06 
 
 
504 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.86 
 
 
504 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.17 
 
 
506 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.17 
 
 
506 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.17 
 
 
506 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.17 
 
 
506 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  36.36 
 
 
503 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.33 
 
 
504 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  37.95 
 
 
506 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  35.59 
 
 
497 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.13 
 
 
508 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  35.17 
 
 
508 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  36.77 
 
 
506 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.47 
 
 
502 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  37.28 
 
 
500 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  36.83 
 
 
500 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  37.5 
 
 
500 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  37.01 
 
 
504 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  39.6 
 
 
504 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  38.39 
 
 
502 aa  290  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  36.88 
 
 
508 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.49 
 
 
536 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  38.7 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  36.03 
 
 
503 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  36.53 
 
 
502 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.44 
 
 
500 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  39.2 
 
 
501 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  37.95 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  37.22 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.28 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.47 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  36.67 
 
 
502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  37.21 
 
 
497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  34.59 
 
 
504 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  37.5 
 
 
500 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  35.04 
 
 
500 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  37.05 
 
 
500 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  35.42 
 
 
507 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  34.47 
 
 
506 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.12 
 
 
500 aa  280  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  38.38 
 
 
509 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.84 
 
 
501 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  35.5 
 
 
515 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  36.56 
 
 
505 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  34.19 
 
 
508 aa  279  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  38.28 
 
 
510 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.12 
 
 
502 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.34 
 
 
500 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 
509 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  38.51 
 
 
510 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  37.15 
 
 
505 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  34.61 
 
 
509 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.05 
 
 
519 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.93 
 
 
536 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  36 
 
 
499 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  35.71 
 
 
512 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.34 
 
 
505 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>