238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1563 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1036    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.2 
 
 
509 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  41.8 
 
 
658 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  41.5 
 
 
658 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  38.73 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.18 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  41.75 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  43.08 
 
 
500 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  35.43 
 
 
490 aa  319  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.69 
 
 
514 aa  317  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.15 
 
 
514 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.48 
 
 
516 aa  312  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.96 
 
 
520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  36.69 
 
 
506 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  38.65 
 
 
498 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  38.65 
 
 
498 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  35.48 
 
 
498 aa  290  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.21 
 
 
503 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.69 
 
 
519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.81 
 
 
502 aa  286  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.79 
 
 
536 aa  286  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.36 
 
 
493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.78 
 
 
502 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  37.17 
 
 
494 aa  280  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  37.69 
 
 
499 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.6 
 
 
536 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  35.85 
 
 
504 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.29 
 
 
504 aa  276  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  33.73 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  35.12 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.93 
 
 
497 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  33.84 
 
 
505 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  35.07 
 
 
504 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  35.07 
 
 
504 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  35.2 
 
 
504 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  35.2 
 
 
504 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.33 
 
 
502 aa  272  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  35.54 
 
 
505 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.68 
 
 
491 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.63 
 
 
506 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.34 
 
 
504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.63 
 
 
497 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  37.53 
 
 
497 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  36.18 
 
 
500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.92 
 
 
508 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  37.39 
 
 
496 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  37.39 
 
 
496 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  37.39 
 
 
496 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  36.36 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.08 
 
 
504 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  36.96 
 
 
508 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  33.47 
 
 
507 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  35.03 
 
 
505 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  32.82 
 
 
504 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  35.14 
 
 
506 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.54 
 
 
508 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  33.01 
 
 
504 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  32.62 
 
 
504 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  34.84 
 
 
502 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  35.64 
 
 
495 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  32.43 
 
 
504 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  34.85 
 
 
539 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  35.89 
 
 
505 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  34.29 
 
 
499 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  34.95 
 
 
504 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  35.14 
 
 
494 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  36.6 
 
 
506 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.96 
 
 
500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  35.04 
 
 
508 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.87 
 
 
505 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.75 
 
 
503 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  32.71 
 
 
506 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.68 
 
 
506 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  34.22 
 
 
497 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  33.86 
 
 
509 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  32.43 
 
 
504 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.47 
 
 
506 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.47 
 
 
506 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  39.59 
 
 
499 aa  251  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.47 
 
 
506 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.47 
 
 
506 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  34.41 
 
 
502 aa  250  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  35.27 
 
 
504 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.46 
 
 
497 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  33.47 
 
 
500 aa  249  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3508  hypothetical protein  34.56 
 
 
496 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0428197  decreased coverage  0.0000798932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.13 
 
 
506 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  33.4 
 
 
504 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  33.83 
 
 
504 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  38.58 
 
 
508 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  32.57 
 
 
505 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  35.84 
 
 
506 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36 
 
 
504 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  34.74 
 
 
512 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  35.84 
 
 
506 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  33.73 
 
 
506 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  35.29 
 
 
515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  33.26 
 
 
497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  34.83 
 
 
500 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  31.99 
 
 
503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>