238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1218 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 504 aa  975    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  46.41 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  46.4 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  44.26 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  50.31 
 
 		 510 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  50.1 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  48.79 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  50.52 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  44.23 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  45.47 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  46.73 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  47.42 
 
 		 509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  46.97 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  46.33 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.92 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.94 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.36 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  42 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.28 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  40.99 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.19 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  40.99 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.19 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  40.99 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.23 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.24 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.39 
 
 		 536 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  40.63 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  40.8 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  42.68 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  40.16 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.22 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  40.83 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  40.91 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  40.83 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.27 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  42.68 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  41.75 
 
 		 508 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  40.63 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  39.28 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  40.16 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  40.83 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  40.93 
 
 		 500 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  40.32 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  40.32 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  40.32 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.32 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  40.52 
 
 		 506 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  42.04 
 
 		 508 aa  363  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  42.16 
 
 		 503 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  40.72 
 
 		 500 aa  362  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  42.04 
 
 		 508 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  40.63 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.63 
 
 		 508 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.56 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  41.06 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  40.3 
 
 		 500 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  42.41 
 
 		 499 aa  359  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  43.06 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  40.64 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  40.68 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.64 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  40.96 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.81 
 
 		 504 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  41.92 
 
 		 509 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.37 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  38.48 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  39.3 
 
 		 496 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.6 
 
 		 500 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.28 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  38.76 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.48 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  41.01 
 
 		 506 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.55 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  40.33 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  42.04 
 
 		 509 aa  349  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  41.35 
 
 		 500 aa  349  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  40 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.76 
 
 		 536 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.55 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  39.6 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  39.48 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  42.46 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.47 
 
 		 503 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  40.13 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.3 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  41.38 
 
 		 504 aa  339  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  42.43 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  42.68 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  40.46 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  40.51 
 
 		 512 aa  336  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  40.51 
 
 		 503 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.73 
 
 		 500 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.35 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  40.08 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  42.49 
 
 		 508 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  37.82 
 
 		 503 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  38.68 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  39.51 
 
 		 505 aa  329  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  38.62 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>