238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0243 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  72.07 
 
 		 500 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  966    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.88 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.28 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.39 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.44 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50 
 
 		 536 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  47.35 
 
 		 500 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.79 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  46.25 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  46.84 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  46.78 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.79 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  46.89 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.44 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  45.42 
 
 		 504 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  47.3 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  45.44 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.61 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  45.28 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.47 
 
 		 500 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.27 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  45.08 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  46.5 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  47.54 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  46.93 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  45.51 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  44.59 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  44.78 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.53 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  48.87 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.22 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  46.72 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  43.18 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.77 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.4 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  43.18 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  43.18 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.18 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  46.17 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  43.18 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  43.38 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  43.97 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  45.66 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.47 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  46.03 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.96 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  47.24 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  46.72 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.77 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.19 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  45.25 
 
 		 508 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  45.38 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.82 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  44.07 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  44.07 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  42.28 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  44.07 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  48.41 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  44.28 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  44.07 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  43.97 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  44.07 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  42.83 
 
 		 500 aa  392  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.17 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  44.02 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  45.65 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  44.4 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  46.14 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.05 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  43.41 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  45.79 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  44.12 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  49.04 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  47.19 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  45.54 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  44.7 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  45.62 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  42.57 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  46.03 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  44.38 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  45.6 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  45.4 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  45.65 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  44.4 
 
 		 504 aa  379  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.58 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  44.56 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.97 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  44.35 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.03 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.88 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  47.46 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  42.31 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  41.58 
 
 		 519 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  44.26 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  48.2 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.49 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  47.46 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  45.61 
 
 		 495 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  44.74 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>