238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1851 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  71.31 
 
 		 505 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  91.37 
 
 		 510 aa  859    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  978    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  74.95 
 
 		 509 aa  701    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  91.57 
 
 		 510 aa  862    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  67.47 
 
 		 504 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  68.03 
 
 		 506 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  71.11 
 
 		 508 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  73.33 
 
 		 509 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  77.89 
 
 		 504 aa  726    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  64.89 
 
 		 506 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  63.24 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  60.08 
 
 		 509 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  61.57 
 
 		 512 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.52 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.91 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.58 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  44.2 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.72 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.43 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.43 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.43 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.43 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.43 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.96 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  42.49 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.55 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  42.04 
 
 		 504 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  41.88 
 
 		 504 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  40.24 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  42.04 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  43.72 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  41.61 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.68 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  39.84 
 
 		 504 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  40.9 
 
 		 508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.67 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.35 
 
 		 503 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  40.12 
 
 		 504 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.83 
 
 		 500 aa  355  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  43.64 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.86 
 
 		 536 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  41.83 
 
 		 504 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.35 
 
 		 519 aa  349  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  38.89 
 
 		 498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.82 
 
 		 536 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  41.23 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  40.76 
 
 		 505 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  44.75 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.78 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  40.95 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  40.84 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  40.98 
 
 		 505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.22 
 
 		 504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  37.99 
 
 		 507 aa  336  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  42.2 
 
 		 500 aa  333  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  42.04 
 
 		 505 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  41.83 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  37.18 
 
 		 519 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  43.8 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  41.49 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.18 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.61 
 
 		 515 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  40.93 
 
 		 504 aa  326  6e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  41.58 
 
 		 502 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  40.08 
 
 		 503 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.47 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  42.54 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  38.66 
 
 		 502 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  38.7 
 
 		 515 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  36.65 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  38.61 
 
 		 494 aa  319  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  36.8 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  44.09 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  36.8 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  36.8 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  37.5 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  36.8 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.8 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  40.67 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.05 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  41.04 
 
 		 500 aa  317  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  36.83 
 
 		 506 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  38.17 
 
 		 500 aa  316  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  39.24 
 
 		 500 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.46 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  38.82 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  41.09 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  38.72 
 
 		 502 aa  314  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.13 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  39.46 
 
 		 498 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  36.84 
 
 		 529 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  39.32 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.7 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  39.4 
 
 		 495 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  35.53 
 
 		 509 aa  310  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  40.34 
 
 		 505 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  37.82 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.49 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  40.51 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>