237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0724 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  961    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  58.12 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  57.46 
 
 
504 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  57.46 
 
 
504 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  57.46 
 
 
504 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  57.46 
 
 
504 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  57.26 
 
 
504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  60.74 
 
 
506 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.83 
 
 
500 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  60.24 
 
 
495 aa  561  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  56.43 
 
 
504 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  56.83 
 
 
504 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  56.57 
 
 
504 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  55.56 
 
 
504 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.43 
 
 
505 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  59.7 
 
 
505 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  55.56 
 
 
504 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  55.76 
 
 
504 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  55.53 
 
 
504 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  55.28 
 
 
498 aa  535  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.55 
 
 
497 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  54.38 
 
 
506 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  57.26 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  53.32 
 
 
508 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  56.96 
 
 
505 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.74 
 
 
503 aa  482  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  52.72 
 
 
504 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  52.33 
 
 
503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  50.2 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  53.88 
 
 
502 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  51 
 
 
501 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.95 
 
 
506 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.41 
 
 
506 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  43.41 
 
 
506 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  43.41 
 
 
506 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  43.41 
 
 
506 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  43.61 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  43.41 
 
 
506 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  41.78 
 
 
508 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.42 
 
 
508 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  44.4 
 
 
508 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  44.2 
 
 
508 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.87 
 
 
497 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  44.2 
 
 
503 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  43.17 
 
 
504 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  42.71 
 
 
509 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.97 
 
 
504 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  43.09 
 
 
505 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.97 
 
 
536 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  42.26 
 
 
500 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  43.43 
 
 
509 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  43.63 
 
 
503 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  44.01 
 
 
503 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.32 
 
 
519 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  43.09 
 
 
501 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  43.04 
 
 
502 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.3 
 
 
503 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  41.98 
 
 
500 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  45.12 
 
 
495 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.89 
 
 
501 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  43.46 
 
 
502 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  42.26 
 
 
500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  43.49 
 
 
505 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.74 
 
 
507 aa  362  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  41.57 
 
 
500 aa  360  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.57 
 
 
536 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.54 
 
 
503 aa  358  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.6 
 
 
502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.67 
 
 
499 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.01 
 
 
504 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  42.52 
 
 
500 aa  356  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  42.68 
 
 
504 aa  356  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  43.12 
 
 
503 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  45.14 
 
 
512 aa  355  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  42.86 
 
 
489 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.97 
 
 
500 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  43.49 
 
 
504 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  42.71 
 
 
500 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.97 
 
 
500 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.12 
 
 
506 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  43.45 
 
 
504 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  42 
 
 
509 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  41.33 
 
 
506 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.65 
 
 
505 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  42.12 
 
 
500 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  42.13 
 
 
505 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  44.03 
 
 
503 aa  346  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3487  hypothetical protein  42.89 
 
 
508 aa  345  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.812396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  44.33 
 
 
510 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.92 
 
 
505 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  42.24 
 
 
505 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.19 
 
 
500 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  43.4 
 
 
500 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  42.04 
 
 
505 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  42.05 
 
 
499 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  42.89 
 
 
504 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  41.84 
 
 
505 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  42.89 
 
 
504 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  41.95 
 
 
515 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  43.09 
 
 
502 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>