238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  65.94 
 
 
504 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  67.2 
 
 
509 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  67.39 
 
 
509 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  68.2 
 
 
508 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  68.43 
 
 
512 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  997    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  67.55 
 
 
509 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  98.42 
 
 
506 aa  983    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  62.25 
 
 
506 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  66.87 
 
 
504 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  66.33 
 
 
505 aa  624  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  64.23 
 
 
510 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  65.5 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  63.24 
 
 
499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.85 
 
 
504 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.62 
 
 
503 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.45 
 
 
497 aa  359  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.05 
 
 
519 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  38.39 
 
 
500 aa  356  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  40.47 
 
 
504 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  40.28 
 
 
504 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  40.08 
 
 
504 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  40.2 
 
 
504 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.64 
 
 
504 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  40.2 
 
 
504 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  40.61 
 
 
506 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  39.59 
 
 
504 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  38.22 
 
 
508 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  40.12 
 
 
506 aa  347  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.28 
 
 
506 aa  346  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  38.1 
 
 
504 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  38.1 
 
 
504 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  38.1 
 
 
504 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  38.1 
 
 
504 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  38.1 
 
 
504 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  39.8 
 
 
504 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.41 
 
 
536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.84 
 
 
500 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  38.84 
 
 
504 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.58 
 
 
505 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.6 
 
 
536 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  38.51 
 
 
506 aa  340  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  37.33 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.6 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  37.85 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  38.28 
 
 
506 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  38.67 
 
 
506 aa  336  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.28 
 
 
506 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.28 
 
 
506 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.28 
 
 
506 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.28 
 
 
506 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  38.66 
 
 
507 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  39.5 
 
 
505 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  38.98 
 
 
505 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  42.91 
 
 
500 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.17 
 
 
504 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.99 
 
 
502 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  39.53 
 
 
500 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  37.53 
 
 
505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  38.32 
 
 
494 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  38.69 
 
 
500 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  37.98 
 
 
503 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  41.92 
 
 
500 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.54 
 
 
508 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  38.42 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54570  hypothetical protein  40.59 
 
 
505 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000228538  normal  0.10446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.32 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3854  hypothetical protein  39.63 
 
 
501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000632831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  37.79 
 
 
500 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  36.13 
 
 
504 aa  320  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 
508 aa  319  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.67 
 
 
519 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.16 
 
 
500 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  39.01 
 
 
500 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.02 
 
 
500 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  38.96 
 
 
512 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4768  hypothetical protein  40.17 
 
 
505 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.51 
 
 
508 aa  316  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  37.84 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  38.07 
 
 
500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  38.85 
 
 
499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  39.41 
 
 
504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  38.27 
 
 
500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  37.17 
 
 
495 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.18 
 
 
505 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  36.99 
 
 
501 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  38.25 
 
 
498 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  37.37 
 
 
505 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  38.74 
 
 
503 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.99 
 
 
501 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  35.53 
 
 
515 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  41.86 
 
 
508 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.58 
 
 
505 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  38.07 
 
 
500 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  37.39 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  37.6 
 
 
505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.71 
 
 
508 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  37.04 
 
 
505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  35.43 
 
 
508 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.37 
 
 
500 aa  306  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>