237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3714 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3508  hypothetical protein  70.58 
 
 		 496 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0428197  decreased coverage  0.0000798932 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1059    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3183  hypothetical protein  48.17 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  36.27 
 
 		 494 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  34.82 
 
 		 498 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  38.43 
 
 		 494 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  36.5 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  37.2 
 
 		 500 aa  286  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.46 
 
 		 503 aa  280  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.86 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.8 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.04 
 
 		 497 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  36.3 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  34.82 
 
 		 502 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  35.81 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  36.23 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.18 
 
 		 503 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  33.9 
 
 		 501 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.41 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  35.87 
 
 		 500 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  36.17 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  34.88 
 
 		 500 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  34.39 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  36.7 
 
 		 505 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.92 
 
 		 536 aa  260  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  33.54 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.31 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.69 
 
 		 501 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  33.61 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  35.04 
 
 		 508 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  34.88 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  33.75 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  34.46 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  36.31 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  33.54 
 
 		 504 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  33.26 
 
 		 504 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.26 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  33.97 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.26 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  33.06 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  37.27 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.26 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.06 
 
 		 506 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  34.39 
 
 		 507 aa  256  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.95 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.95 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.63 
 
 		 497 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  34.85 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  34.9 
 
 		 503 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  35.62 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  33.47 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  35.81 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  32.85 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  34.22 
 
 		 500 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  34.16 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  34.43 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  34.1 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  34.52 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.3 
 
 		 503 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  34.55 
 
 		 505 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  33.05 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  34.03 
 
 		 512 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  33.07 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  38.15 
 
 		 503 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  32.21 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  34.3 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  36.48 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  34.53 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  37.76 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  35.06 
 
 		 500 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  36.45 
 
 		 498 aa  247  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  34.67 
 
 		 505 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  33.54 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  33.54 
 
 		 500 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.4 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  37.37 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.77 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  36.44 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  31.27 
 
 		 503 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  34.85 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  34.85 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  34.37 
 
 		 505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  33.33 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.54 
 
 		 501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  33.33 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  32.17 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 		 506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  37.98 
 
 		 658 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.62 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  34.63 
 
 		 505 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  36.17 
 
 		 658 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  36.64 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.25 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.51 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  35.18 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  36.64 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  35.63 
 
 		 499 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  33.4 
 
 		 502 aa  241  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>