238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2439 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  952    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  54.88 
 
 		 497 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.29 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  51.63 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  51.5 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  54.78 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  51.91 
 
 		 497 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  52.66 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.73 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  35.9 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  39.27 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  37.2 
 
 		 494 aa  316  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  40.12 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  40.12 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  40.12 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0608  hypothetical protein  40.2 
 
 		 487 aa  307  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00222662  normal  0.0295774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.4 
 
 		 493 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  38.59 
 
 		 498 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  37.92 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  38.46 
 
 		 498 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  37.37 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  37.15 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.85 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.21 
 
 		 514 aa  292  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.03 
 
 		 519 aa  291  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.22 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  35.74 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  34.04 
 
 		 507 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  37.1 
 
 		 658 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  37.18 
 
 		 658 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.5 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.73 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.07 
 
 		 516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.09 
 
 		 508 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  37.08 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  34.85 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  35.7 
 
 		 499 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  33.89 
 
 		 502 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.37 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.56 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  33.75 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.99 
 
 		 536 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  34.04 
 
 		 513 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.35 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  34.99 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  36.07 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  34.15 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  34.15 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  34.15 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.62 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  34.15 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  33.74 
 
 		 529 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  36.25 
 
 		 499 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.06 
 
 		 536 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  32.14 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.92 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  33.47 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  35.29 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  35.22 
 
 		 529 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  32.93 
 
 		 508 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  38.6 
 
 		 500 aa  266  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  32.14 
 
 		 500 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.32 
 
 		 502 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  29.47 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.43 
 
 		 501 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  33.19 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  37.01 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  36.96 
 
 		 506 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  31.71 
 
 		 500 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.52 
 
 		 504 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.93 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  33.95 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.26 
 
 		 531 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  33.62 
 
 		 499 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  33.88 
 
 		 505 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  36.34 
 
 		 500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  36.5 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.56 
 
 		 500 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  34.31 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.86 
 
 		 497 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  32.89 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  32.73 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  31.5 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  32.24 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.92 
 
 		 500 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  32.98 
 
 		 501 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  31.5 
 
 		 500 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  33.95 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  32.17 
 
 		 505 aa  257  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  33.86 
 
 		 505 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.6 
 
 		 500 aa  257  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  31.5 
 
 		 500 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  31.1 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  33.06 
 
 		 500 aa  256  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  35.52 
 
 		 512 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  32.36 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>