237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1067 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1000    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 494 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  37.97 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.56 
 
 		 506 aa  334  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.1 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  38.02 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.74 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.66 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  38.27 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  40.51 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  38.07 
 
 		 504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  40.51 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.63 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  40.51 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.92 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.32 
 
 		 536 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.58 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  38.3 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  38.1 
 
 		 504 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  37.78 
 
 		 504 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.04 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.31 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  38.69 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  37.47 
 
 		 504 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  37.73 
 
 		 504 aa  296  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  35.73 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  37.34 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  37.87 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.36 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.98 
 
 		 519 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.57 
 
 		 505 aa  293  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  37.76 
 
 		 658 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  38.64 
 
 		 494 aa  293  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  38.91 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  35.39 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  36.59 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  37.97 
 
 		 658 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  38.49 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  36.65 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  36.65 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  36.75 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  36.38 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  36.75 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.91 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.69 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.3 
 
 		 514 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  39.09 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  38.59 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  36.71 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  38.3 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2822  hypothetical protein  39.17 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0537355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  37.99 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  37.53 
 
 		 504 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  38.12 
 
 		 512 aa  282  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  37.09 
 
 		 508 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.61 
 
 		 531 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  34.74 
 
 		 513 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  37.15 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.22 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.48 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.39 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.09 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.71 
 
 		 500 aa  281  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  35.67 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.29 
 
 		 536 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  34.98 
 
 		 508 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  34.17 
 
 		 507 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  37.37 
 
 		 494 aa  279  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  35.74 
 
 		 502 aa  279  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  36.82 
 
 		 506 aa  279  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3786  hypothetical protein  37.45 
 
 		 503 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  35.95 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  34.96 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.77 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.64 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.07 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.07 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.07 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.07 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.07 
 
 		 506 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  33.01 
 
 		 509 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  39.52 
 
 		 500 aa  276  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  35.46 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  36.24 
 
 		 499 aa  276  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  36.09 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  35.98 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  35 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.84 
 
 		 520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  36.53 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  36.02 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  34.51 
 
 		 529 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  32.67 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  36.9 
 
 		 500 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  37.61 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  34.26 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  34.69 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  35.73 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  34.45 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  35.43 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  35.99 
 
 		 496 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>